Skip to main content
. 2009 Jul 22;284(43):29893–29904. doi: 10.1074/jbc.M109.028449

TABLE 1.

TaqMan primer and probe sequences for mouse genes

Probes were labeled with 6-carboxyfluorescein (FAM) and 6-carboxy-N,N,N′,N′-tetramethylrhodamine (TAMRA).

Gene Sequence
TIMP1
    Forward primer 5′-CATGGAAAGCCTCTGTGGATATG-3′
    Reverse primer 5′-AAGCTGCAGGCACTGATGTG-3′
    Probe 5′-FAM-CTCATCACGGGCCGCCTAAGGAAC-TAMRA-3′

MMP2
    Forward primer 5′-AACTACGATGATGACCGGAAGTG-3′
    Reverse primer 5′-TGGCATGGCCGAACTCA-3′
    Probe 5′-FAM-TCTGTCCTGACCAAGGATATAGCCTATTCCTCG-TAMRA-3′

MMP8
    Forward primer 5′-GATTCAGAAGAAACGTGGACTCAA-3′
    Reverse primer 5′-CATCAAGGCACCAGGATCAGT-3′
    Probe 5′-FAM-CATGAATTTGGACATTCTTTGGGACTCTCTCAC-TAMRA-3′

MMP9
    Forward primer 5′-CGAACTTCGACACTGACAAGAAGT-3′
    Reverse primer 5′-GCACGCTGGAATGATCTAAGC-3′
    Probe 5′-FAM-TCTGTCCAGACCAAGGGTACAGCCTGTTC-TAMRA-3′

MMP13
    Forward primer 5′-GGGCTCTGAATGGTTATGACATTC-3′
    Reverse primer 5′-AGCGCTCAGTCTCTTCACCTCTT-3′
    Probe 5′-AAGGTTATCCCAGAAAAATATCTGACCTGGGATTC-3′

MMP14 (MT1-MMP)
    Forward primer 5′-AGGAGACAGAGGTGATCATCATTG-3′
    Reverse primer 5′-GTCCCATGGCGTCTGAAGA-3′
    Probe 5′-FAM-CCTGCCGGTACTACTGCTGCTCCTG-TAMRA-3′

TNFα
    Forward primer 5′-ACAAGGCTGCCCCGACTAC-3′
    Reverse primer 5′-TTTCTCCTGGTATGAGATAGCAAATC-3′
    Probe 5′-FAM-TGCTCCTCACCCACACCGTCAGC-TAMRA-3′

TGFß1
    Forward primer 5′-CCTGCAAGACCATCGACATG-3′
    Reverse primer 5′-ACAGGATCTGGCCACGGAT-3′
    Probe 5′-FAM-CTGGTGAAACGGAAGCGCATCGAA-TAMRA-3′

Pro-col I-α1
    Forward primer 5′-CTTCACCTACAGCACCCTTGTG-3′
    Reverse primer 5′-TGACTGTCTTGCCCCAAGTTC-3′
    Probe 5′-FAM-CTGCACGAGTCACACC-TAMRA-3′

Pro-col III-α1
    Forward primer 5′-TGTCCTTTGCGATGACATAATCTG-3′
    Reverse primer 5′-AATGGGATCTCTGGGTTGGG-3′
    Probe 5′-FAM-ATGAGGAGCCACTAGACT-TAMRA-3′