Table 2.
Gene Symbol |
WT | WT-OGD | Ngb-Tg | Ngb-OGD |
---|---|---|---|---|
Mean±SD | Mean± SD | Mean± SD | Mean± SD | |
Gapdh | 8.15±0.79 | 7.23±0.62 | 7.66±0.14 | 8.07±0.57 |
Add1 | 0.62±0.32 | 0.26±0.10 | 0.35±0.13 | 0.27±0.05 |
Agtpbp1 | 0.83±0.09 | 0.42±0.32 | 0.68±0.25 | 0.73±0.13 |
Arnt2 | 0.13±0.08 | 0.04±0.02 | 0.08±0.05 | 0.10±0.09 |
Bax | 1.06±0.12 | 0.97±0.12 | 1.02±0.09 | 0.94±0.09 |
Camk2g | 0.15±0.04 | 0.06±0.04 | 0.05±0.01 | 0.07±0.09 |
Cat | 0.83±0.08 | 0.30±0.14 | 0.22±0.11 | 0.11±0.02 |
Cdc42 | 6.09±0.48 | 4.04±0.30 | 5.77±0.44 | 3.03±0.27 |
Crebbp | 0.33±0.19 | 0.52±0.17 | 0.37±0.24 | 0.29±0.15 |
Cstb | 0.70±0.08 | 0.39±0.08 | 0.40±0.05 | 0.45±0.06 |
Ctgf | 0.36±0.08 | 0.30±0.13 | 0.64±0.24 | 0.29±0.02 |
Cygb | 0.79±0.15 | 0.48±0.10 | 0.50±0.15 | 0.42±0.07 |
Dctn2 | 4.31±0.27 | 3.59±0.21 | 4.57±0.55 | 2.44±0.28 |
Dnajb1 | 1.98±0.15 | 1.32±0.12 | 2.01±0.14 | 1.05±0.06 |
Dr1 | 0.18±0.01 | 0.05±0.01 | 0.06±0.02 | 0.05±0.01 |
Eef1a1 | 8.19±0.68 | 8.18±0.61 | 5.76±0.53 | 5.46±0.37 |
Ece1 | 0.61±0.78 | 0.33±0.33 | 0.52±0.68 | 0.24±0.16 |
Egfr | 0.21±0.03 | 0.16±0.04 | 0.21±0.01 | 0.13±0.04 |
Egln2 | 3.29±0.27 | 1.75±0.21 | 2.87±0.24 | 2.04±0.14 |
Eno1 | 0.42±0.48 | 0.16±0.15 | 0.19±0.22 | 0.13±0.13 |
Epas1 | 0.40±0.03 | 0.17±0.06 | 0.16±0.06 | 0.11±0.01 |
Fos | 0.17±0.07 | 1.20±0.11 | 0.55±0.38 | 1.03±0.09 |
Gap43 | 5.14±0.37 | 4.66±0.41 | 4.05±0.44 | 2.38±0.19 |
Gna11 | 0.16±0.01 | 0.11±0.05 | 0.08±0.03 | 0.07±0.04 |
Gpi1 | 5.24±0.38 | 4.04±0.40 | 3.84±0.43 | 3.01±0.27 |
Gpx1 | 1.07±0.06 | 0.93±0.01 | 0.77±0.17 | 0.62±0.09 |
Gsto1 | 1.55±0.07 | 1.05±0.05 | 1.10±0.05 | 0.88±0.09 |
Hbb-y | 4.38±0.08 | 4.64±0.11 | 4.03±0.13 | 2.15±0.08 |
Hif1a | 0.18±0.06 | 0.06±0.02 | 0.05±0.01 | 0.04±0.01 |
Hk2 | 0.45±0.58 | 0.20±0.21 | 0.19±0.23 | 0.11±0.10 |
Hmox1 | 0.34±0.02 | 0.54±0.18 | 0.19±0.12 | 0.28±0.11 |
Id1 | 0.29±0.08 | 0.28±0.17 | 0.11±0.07 | 0.07±0.03 |
Id2 | 3.71±0.28 | 1.52±0.09 | 2.58±0.15 | 1.02±0.04 |
Il6st | 0.92±0.06 | 0.44±0.17 | 0.79±0.21 | 0.68±0.13 |
Iqgap1 | 0.19±0.10 | 0.16±0.09 | 0.15±0.08 | 0.10±0.04 |
Khsrp | 0.93±0.08 | 0.54±0.10 | 0.54±0.16 | 0.28±0.12 |
Kit | 0.20±0.07 | 0.03±0.01 | 0.11±0.04 | 0.04±0.01 |
Man2b1 | 0.20±0.06 | 0.08±0.02 | 0.24±0.11 | 0.16±0.05 |
Mars | 0.20±0.06 | 0.05±0.02 | 0.12±0.07 | 0.08±0.07 |
Mmp14 | 0.59±0.16 | 0.08±0.02 | 0.20±0.07 | 0.02±0.01 |
Mocs3 | 0.42±0.15 | 0.10±0.03 | 0.19±0.08 | 0.10±0.04 |
Mt3 | 1.52±0.07 | 0.90±0.03 | 1.43±0.11 | 0.61±0.07 |
Mybl2 | 0.23±0.02 | 0.18±0.07 | 0.16±0.03 | 0.13±0.01 |
Nmyc1 | 2.73±0.16 | 1.25±0.29 | 1.18±0.07 | 0.29±0.02 |
Notch1 | 0.72±0.21 | 0.36±0.18 | 0.61±0.31 | 0.13±0.06 |
Npy | 2.70±0.17 | 2.11±0.09 | 3.51±0.34 | 1.50±0.12 |
Nudt2 | 0.32±0.06 | 0.10±0.02 | 0.16±0.04 | 0.04±0.02 |
Pea15 | 1.00±0.06 | 0.69±0.19 | 0.81±0.13 | 0.38±0.13 |
Ppp2cb | 1.09±0.10 | 0.90±0.08 | 1.01±0.08 | 0.73±0.17 |
Psmb3 | 4.32±0.27 | 3.44±0.31 | 4.61±0.53 | 1.90±0.14 |
Psme2 | 0.96±0.15 | 0.34±0.23 | 0.75±0.50 | 0.70±0.11 |
Rara | 0.14±0.01 | 0.07±0.01 | 0.09±0.03 | 0.11±0.05 |
Rpl28 | 1.89±0.16 | 1.47±0.10 | 1.56±0.12 | 0.74±0.04 |
Rpl32 | 5.96±0.37 | 6.72±0.72 | 6.22±0.84 | 3.95±0.27 |
Rpl37 | 0.36±0.11 | 0.23±0.04 | 0.36±0.04 | 0.31±0.04 |
Rps2 | 6.99±0.37 | 6.96±0.41 | 6.51±0.54 | 4.74±0.37 |
Rps7 | 0.48±0.06 | 0.26±0.05 | 0.38±0.10 | 0.25±0.14 |
Rps8 | 0.07±0.05 | 0.06±0.03 | 0.07±0.05 | 0.04±0.02 |
Sdh1 | 1.07±0.04 | 1.10±0.02 | 0.89±0.14 | 0.95±0.03 |
Snrp70 | 1.10±0.07 | 1.07±0.06 | 1.04±0.07 | 0.94±0.11 |
Sod2 | 2.65±0.28 | 1.62±0.12 | 2.84±0.21 | 1.10±0.09 |
Spnb2 | 0.11±0.07 | 0.09±0.06 | 0.15±0.07 | 0.08±0.03 |
Sumo2 | 6.14±0.36 | 6.04±0.73 | 3.69±0.43 | 2.55±0.29 |
Sae1a | 1.10±0.06 | 0.85±0.19 | 1.02±0.08 | 0.90±0.11 |
Tuba1a | 5.78±0.48 | 6.06±0.59 | 5.49±0.74 | 3.31±0.27 |
Tuba3a | 0.38±0.35 | 0.24±0.24 | 0.24±0.22 | 0.35±0.25 |
Blank | 0.11±0.05 | 0.09±0.02 | 0.10±0.04 | 0.10±0.04 |
Blank | 0.19±0.03 | 0.16±0.04 | 0.21±0.08 | 0.21±0.14 |
Rps27a | 5.13±0.35 | 5.82±0.63 | 5.17±0.52 | 5.07±0.38 |
B2m | 1.00±0.00 | 1.00±0.00 | 1.00±0.00 | 1.00±0.00 |
Hsp90ab1 | 6.16±0.38 | 6.26±0.41 | 6.18±0.45 | 6.79±0.48 |
Ppia | 7.46±0.57 | 7.04±0.60 | 7.18±0.85 | 8.09±0.57 |
BAS2C | 1.07±0.12 | 1.13±0.10 | 1.11±0.14 | 0.97±0.14 |
mRNA levels were normalized by internal control gene B2m. “WT” and “Ngb-Tg” refer to wild type and Ngb-Tg cells under normal rest condition, respectively; “WT-OGD” and “Ngb-OGD” refer to wild type and Ngb-Tg neurons after OGD, respectively. BAS2C is an artificial sequence serving as a detection control.