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. Author manuscript; available in PMC: 2010 Aug 18.
Published in final edited form as: Neuroscience. 2009 May 3;162(2):396–403. doi: 10.1016/j.neuroscience.2009.04.055

Table 2.

Relative gene mRNA levels of WT or Ngb-Tg neurons before and after O4/R4

Gene
Symbol
WT WT-OGD Ngb-Tg Ngb-OGD
Mean±SD Mean± SD Mean± SD Mean± SD
Gapdh 8.15±0.79 7.23±0.62 7.66±0.14 8.07±0.57
Add1 0.62±0.32 0.26±0.10 0.35±0.13 0.27±0.05
Agtpbp1 0.83±0.09 0.42±0.32 0.68±0.25 0.73±0.13
Arnt2 0.13±0.08 0.04±0.02 0.08±0.05 0.10±0.09
Bax 1.06±0.12 0.97±0.12 1.02±0.09 0.94±0.09
Camk2g 0.15±0.04 0.06±0.04 0.05±0.01 0.07±0.09
Cat 0.83±0.08 0.30±0.14 0.22±0.11 0.11±0.02
Cdc42 6.09±0.48 4.04±0.30 5.77±0.44 3.03±0.27
Crebbp 0.33±0.19 0.52±0.17 0.37±0.24 0.29±0.15
Cstb 0.70±0.08 0.39±0.08 0.40±0.05 0.45±0.06
Ctgf 0.36±0.08 0.30±0.13 0.64±0.24 0.29±0.02
Cygb 0.79±0.15 0.48±0.10 0.50±0.15 0.42±0.07
Dctn2 4.31±0.27 3.59±0.21 4.57±0.55 2.44±0.28
Dnajb1 1.98±0.15 1.32±0.12 2.01±0.14 1.05±0.06
Dr1 0.18±0.01 0.05±0.01 0.06±0.02 0.05±0.01
Eef1a1 8.19±0.68 8.18±0.61 5.76±0.53 5.46±0.37
Ece1 0.61±0.78 0.33±0.33 0.52±0.68 0.24±0.16
Egfr 0.21±0.03 0.16±0.04 0.21±0.01 0.13±0.04
Egln2 3.29±0.27 1.75±0.21 2.87±0.24 2.04±0.14
Eno1 0.42±0.48 0.16±0.15 0.19±0.22 0.13±0.13
Epas1 0.40±0.03 0.17±0.06 0.16±0.06 0.11±0.01
Fos 0.17±0.07 1.20±0.11 0.55±0.38 1.03±0.09
Gap43 5.14±0.37 4.66±0.41 4.05±0.44 2.38±0.19
Gna11 0.16±0.01 0.11±0.05 0.08±0.03 0.07±0.04
Gpi1 5.24±0.38 4.04±0.40 3.84±0.43 3.01±0.27
Gpx1 1.07±0.06 0.93±0.01 0.77±0.17 0.62±0.09
Gsto1 1.55±0.07 1.05±0.05 1.10±0.05 0.88±0.09
Hbb-y 4.38±0.08 4.64±0.11 4.03±0.13 2.15±0.08
Hif1a 0.18±0.06 0.06±0.02 0.05±0.01 0.04±0.01
Hk2 0.45±0.58 0.20±0.21 0.19±0.23 0.11±0.10
Hmox1 0.34±0.02 0.54±0.18 0.19±0.12 0.28±0.11
Id1 0.29±0.08 0.28±0.17 0.11±0.07 0.07±0.03
Id2 3.71±0.28 1.52±0.09 2.58±0.15 1.02±0.04
Il6st 0.92±0.06 0.44±0.17 0.79±0.21 0.68±0.13
Iqgap1 0.19±0.10 0.16±0.09 0.15±0.08 0.10±0.04
Khsrp 0.93±0.08 0.54±0.10 0.54±0.16 0.28±0.12
Kit 0.20±0.07 0.03±0.01 0.11±0.04 0.04±0.01
Man2b1 0.20±0.06 0.08±0.02 0.24±0.11 0.16±0.05
Mars 0.20±0.06 0.05±0.02 0.12±0.07 0.08±0.07
Mmp14 0.59±0.16 0.08±0.02 0.20±0.07 0.02±0.01
Mocs3 0.42±0.15 0.10±0.03 0.19±0.08 0.10±0.04
Mt3 1.52±0.07 0.90±0.03 1.43±0.11 0.61±0.07
Mybl2 0.23±0.02 0.18±0.07 0.16±0.03 0.13±0.01
Nmyc1 2.73±0.16 1.25±0.29 1.18±0.07 0.29±0.02
Notch1 0.72±0.21 0.36±0.18 0.61±0.31 0.13±0.06
Npy 2.70±0.17 2.11±0.09 3.51±0.34 1.50±0.12
Nudt2 0.32±0.06 0.10±0.02 0.16±0.04 0.04±0.02
Pea15 1.00±0.06 0.69±0.19 0.81±0.13 0.38±0.13
Ppp2cb 1.09±0.10 0.90±0.08 1.01±0.08 0.73±0.17
Psmb3 4.32±0.27 3.44±0.31 4.61±0.53 1.90±0.14
Psme2 0.96±0.15 0.34±0.23 0.75±0.50 0.70±0.11
Rara 0.14±0.01 0.07±0.01 0.09±0.03 0.11±0.05
Rpl28 1.89±0.16 1.47±0.10 1.56±0.12 0.74±0.04
Rpl32 5.96±0.37 6.72±0.72 6.22±0.84 3.95±0.27
Rpl37 0.36±0.11 0.23±0.04 0.36±0.04 0.31±0.04
Rps2 6.99±0.37 6.96±0.41 6.51±0.54 4.74±0.37
Rps7 0.48±0.06 0.26±0.05 0.38±0.10 0.25±0.14
Rps8 0.07±0.05 0.06±0.03 0.07±0.05 0.04±0.02
Sdh1 1.07±0.04 1.10±0.02 0.89±0.14 0.95±0.03
Snrp70 1.10±0.07 1.07±0.06 1.04±0.07 0.94±0.11
Sod2 2.65±0.28 1.62±0.12 2.84±0.21 1.10±0.09
Spnb2 0.11±0.07 0.09±0.06 0.15±0.07 0.08±0.03
Sumo2 6.14±0.36 6.04±0.73 3.69±0.43 2.55±0.29
Sae1a 1.10±0.06 0.85±0.19 1.02±0.08 0.90±0.11
Tuba1a 5.78±0.48 6.06±0.59 5.49±0.74 3.31±0.27
Tuba3a 0.38±0.35 0.24±0.24 0.24±0.22 0.35±0.25
Blank 0.11±0.05 0.09±0.02 0.10±0.04 0.10±0.04
Blank 0.19±0.03 0.16±0.04 0.21±0.08 0.21±0.14
Rps27a 5.13±0.35 5.82±0.63 5.17±0.52 5.07±0.38
B2m 1.00±0.00 1.00±0.00 1.00±0.00 1.00±0.00
Hsp90ab1 6.16±0.38 6.26±0.41 6.18±0.45 6.79±0.48
Ppia 7.46±0.57 7.04±0.60 7.18±0.85 8.09±0.57
BAS2C 1.07±0.12 1.13±0.10 1.11±0.14 0.97±0.14

mRNA levels were normalized by internal control gene B2m. “WT” and “Ngb-Tg” refer to wild type and Ngb-Tg cells under normal rest condition, respectively; “WT-OGD” and “Ngb-OGD” refer to wild type and Ngb-Tg neurons after OGD, respectively. BAS2C is an artificial sequence serving as a detection control.