Skip to main content
. 2009 Aug 21;18(11):2219–2230. doi: 10.1002/pro.233

Table I.

Hydrogen-Bonding Distances between 2LTRZFP Residues and DNA Residues

2LTRZFP residue DNA residue Distance (Å) 2LTRZFP residue DNA residue Distance (Å)
Finger 1 ARG16(NH) Zif1:DG187(O6) 2.97 Finger 4 SER99(OH) Zif1:DT177(O2P) 2.56
Zif2:DG187(O6) 3.29 Zif2:DT177(O2P) 2.56
LYS19(NZ) Zif1:DG186(O6) 2.73 GLN100(O) Zif1:DA178(N6) 2.86
Zif2:DA186(N6) 3.21 Zif2:DT178
ARG22(NH) Zif1:DG185(O2P) 2.77 ARG106(NH) Zif1:DG176(O6) 3.16
Zif2:DT185(O2P) 2.74 Zif2:DC176(N4) 3.13
Finger 2 SER43(OH) Zif1:DA183(O1P) 2.66 Finger 5 SER127(OH) Zif1:DC174(O2P) 2.57
Zif2:DT183(O1P) 2.61 Zif2:DA174(O2P) 2.58
ASN47(ND) Zif1:DA183(O2P) 2.80 ASP131(OH) Zif1:DC174(N4) 2.95
Zif2:DT183(O2P) 2.77 Zif2:DA174
ARG50(NH) Zif1:DG182(O6) 2.82 ARG134(NH) Zif1:DG173(O6) 2.99
Zif2:DA182(N6) 2.94 Zif2:DT173(O4) 2.99
Finger 3 ARG72(NH) Zif1:DG181(O6) 2.75 Finger 6 SER155(OH) Zif1:DT171(O2P) 2.57
Zif2:DC181 Zif2:DG171(O2P) 2.52
ASP74(OH) Zif1:DC195(N4) 2.76 GLN156(NH) Zif1:DT171(O2P) 2.82
Zif2:DT195 Zif2:DG171(O2P) 2.83
GLU78(OH) Zif1:DC179(N4) 2.87 GLU162(OH) Zif1:DC170(N4) 2.85
Zif2:DA179 Zif2:DT170

Atom names are indicated in parentheses.