Table 3.

Downstream effector analysis of NF1-related MPNSTs

	Biochemical Analysis							DNA Analysis
		AKT		MAPK		mTOR		PI3KCA		PTEN
Case	PTEN Exp	Exp	Phosph	Exp	Phosph	Exp	Phosph	Mut	FISH	Mut	FISH	KRAS Mut	HRAS Mut	NRAS Mut	BRAF Mut
1a	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE	M	NE	D	NE	NE	NE	NE
1b	+	+	−	+	+	−	+	wt	D	wt	D	wt	wt	wt	wt
2	NE	++	+	++	+	NE	NE	wt	D	wt	M	wt	wt	wt	wt
3b	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE	wt	D	wt	M	wt	wt	wt	wt
4	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE	wt	D	wt	D	wt	wt	wt	wt
5	−	++	+	++	+	+	+	wt	D	wt	D	wt	wt	wt	wt
6a	++	++	+	++	+	+	++	wt	D	wt	M	wt	wt	wt	wt
6c	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE	wt	D	wt	D	wt	wt	wt	wt
7	++	++	+	++	+	+	+	NE	NE	NE	LP	NE	NE	NE	NE
8	++	++	+++	++	+	+	+	wt	LP	wt	M	wt	wt	wt	wt
9	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE	M	NE	M	NE	NE	NE	NE
10	++	++	++	++	++	+	++	wt	LP	wt	M	wt	wt	wt	wt
11	++	NE	NE	NE	NE	NE	NE	wt	NE	wt	D	wt	wt	wt	wt
12	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE	wt	D	wt	D	wt	wt	wt	wt
13	++	++	+	++	+	−	−	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE
14	NE	NE	NE	NE	NE	NE	NE	wt	NE	wt	NE	wt	wt	wt	wt

Abbreviations: Mut, mutational status; NE, not evaluable; wt, wild type; FISH, fluorescence in situ hybridization; M, monosomy; D, disomy; LP, low polysomy; Exp, expression; Phosph, phosphorylation; +, level lower than in the positive control; ++, level similar to that in the positive control; −, no expression.