Table 2.
HIV-1 subtypes and predicted viral tropism among STI patients in Nairobi
| Sample Code |
Age (years) | Gender | HIV-1 Subtype | Predicted phenotype (clones/sample) | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| gag | Pol | Env | R5 | X4 | |||
| 653 | 25 | F | A1 | A1 | A1 | 5/6 | 1/6 |
| 724 | 25 | F | A2 | A2 | A2 | 5/6 | 1/6 |
| 737 | 27 | F | A1 | A1 | A1 | 9/9 | - |
| 738 | 34 | M | A1 | A1 | A1 | 9/9 | - |
| 741 | 35 | M | A1 | A1 | A1 | 5/5 | - |
| 744 | 36 | M | A1 | A1 | A1 | 5/5 | - |
| 760 | 23 | F | D | D | D | - | 5/5 |
| 770 | 29 | F | D | A1 | A1 | 9/9 | - |
| 784 | 35 | M | A1 | A1 | A1 | 5/5 | - |
| 788 | 25 | F | D | D | D | 6/6 | - |
| 790 | 32 | F | A1 | A1 | A1 | 4/4 | - |
| 796 | 31 | M | C | C | C | 5/5 | - |
| 797 | 24 | M | A1 | A1 | A1 | 7/7 | - |
| 798 | 24 | F | A1 | A1 | A1 | 5/5 | - |
| 850 | 32 | M | A1 | A1 | A1 | 4/4 | - |
| 856 | 37 | F | A1 | A1 | N/A | - | - |
| 860 | 26 | F | C | C | A2 | 10/10 | - |
| 864 | 33 | M | A1 | A1 | A1 | 5/5 | - |
| 865 | 33 | M | A2 | A2 | A2 | - | 4/4 |
| 866 | 18 | F | D | D | D | - | 5/5 |
N/A: Not amplified. F: Female. M: Male. R5: CCR5-tropic. X4: CXCR4-tropic.