Skip to main content
. Author manuscript; available in PMC: 2010 Oct 1.
Published in final edited form as: Immunogenetics. 2009 Sep 30;61(10):663. doi: 10.1007/s00251-009-0396-5

Table 1.

Primer sequences for KIR analysis using MALDI-TOF.

Assay Name Forward Capture Primer Reverse Capture Primer hME Primer
2DL1.2DS1.D1.S.tri ACGTTGGATGAAGGCCAACTTCTCCATCA ACGTTGGATGGTGAGTAACAGAACCGTAGC GGTCCCTGCCAGGTCTTGC
2DL1.D1.Gb ACGTTGGATGACTTCTCCATCAGTCGCATGAC ACGTTGGATGATGATCACGATGTCCAGAGG GTCACTGGGAGCTGACA
2DL1.D2.G.no004 ACGTTGGATGCAGGGCCCAAGGTCAACG ACGTTGGATGGACTTTGACCACTCGTAT ATGCTTCGGCTCTTTCC
2DL1.no005.2DL2.004.TC.S ACGTTGGATGGTAATGGACCAAGAGTCTGC ACGTTGGATGCGGGCCGAGGAGTACCTACCT CGCTATTCGCTGTTCTGTT
2DL2.001.2.3.D1.G ACGTTGGATGCCTGCAATGTTGGTCAGATG ACGTTGGATGGGAGCTGACAACTGATAGGG CATGATGGGGTCTCCAA
2DL2.004.TC.G ACGTTGGATGGTAATGGACCAAGAGTCTGC ACGTTGGATGGGCCGAGGAGTACCTACCT GAAACAGAACAGCGAATA
2DL2.D2.S ACGTTGGATGGAGCTCCTATGACATGTACC ACGTTGGATGGCCTGGAATGTTCCGTTGACCTTG CCCTGCAGAGAACCTAC
2DL3.2DL2.D1.S ACGTTGGATGGAGTCCACAGAAAACCTTCCCTCC ACGTTGGATGAGTGTCCTTAAACTTCCCTTCTC CTTCTGATTTCACCAGG
2DL3.TC.S.INT ACGTTGGATGGTAACCCCAGACACCTGCATG ACGTTGGATGCTGCTTCGTGAGACTTACTT TCTCCTTCATCGCTGGTGCT
2DL4.DO.G ACGTTGGATGCCCTGAGCTCTACAACAGAA ACGTTGGATGTGCCGACCACTCAGTGGG TGGAACAGTTTCCTCAT
2DL4.TC.G ACGTTGGATGAGGTGACATACGCACAGTTG ACGTTGGATGATCTGTTGAGGGTCTCTTGC CACAGTTGGATCACTGC
2DL5.D2.G ACGTTGGATGGACTTTCCTCTGGGCCCTG ACGTTGGATGTGACAGAAACAAGCAGTGGG CCACGGAGGGACCTACA
2DL5.TC.G ACGTTGGATGCAAGACCCTCAGGAGGTGAC ACGTTGGATGCTTGGGCCTCTGAGAAGGG CACTGCGTTTTCACACAGA
2DL5sub1 ACGTTGGATGAGGACAAGCCCTTGCTGTCT ACGTTGGATGCAAGACGAGAGCGACACA GTCCTCCTCGAGGCACCACAG
2DL5sub2 ACGTTGGATGCCCTGAGCTCTACAACAA ACGTTGGATGGACATGAGTCCTCTGACCTG CGCTCCCCCATTGAGTGGTC
2DL5sub3 ACGTTGGATGCCCTGAGCTCTACAACAA ACGTTGGATGGACATGAGTCCTCTGACCTG GCAACCCCCTGGTGATC
2DL5sub4 ACGTTGGATGCCACGGAGGGACCTACAC ACGTTGGATGGTGACAGAAACAAGCAGTGG GTGAGTCATGGAGAGAGC
2DL5sub5 ACGTTGGATGGATCTTGGCTTAGCATTTGG ACGTTGGATGCTGCGTTTTCACACAGAC CTTCTCAGAGGCCCAAG
2DL5sub6 ACGTTGGATGTAAGGTGGCGCCTCCTTCTC ACGTTGGATGCAAGACGAGAGCGACACA AGCAAGGGCTTGTCCTG
2DP1.D0.G ACGTTGGATGGGGTTTAACAACTTCAGTCTGT ACGTTGGATGTGTGCTGGGGTCACAGGGCC ATTCTGTTGTAGAGCTCAG
2DS1.D2.G ACGTTGGATGATTCCAGGCCAACTTTCCTC ACGTTGGATGATGGAGAGTCACGGAAAGAG CATCTGTAGGTCCCTCC
2DS2.D1.G ACGTTGGATGCCTGCAATGTTGGTCAGATG ACGTTGGATGAGAAGTTGGCCTTGGAGACC GCACAGAGAGGGGAAGT
2DS2.D2.G ACGTTGGATGGTCTATATGAGAAACCTTC ACGTTGGATGGGACAAGGTCACGCTCTCTC CACGCTCTCTCCTGCCA
2DS3.D1.G ACGTTGGATGAAGGCCAACTTCTCCATCGG ACGTTGGATGCTGTGATCACGATGTCCAG CACTCCCCCTATCAGTT
2DS3.D2.S ACGTTGGATGAGGTCAACGGAACATTCCAGGCCG ACGTTGGATGAAGAGCCGAAGCATCTGTAG CATCTGTAGGTTCCTCC
2DS4.D1.G ACGTTGGATGAGAGACAGTCATCCTGCAATG ACGTTGGATGATGGAGAAGTTGGCCTTGGA GAAGTGCTCAAACATGACATC
2DS4.D2.S ACGTTGGATGGCATCAACGGAACATTCCAGGCC ACGTTGGATGGAGCTCTGTGACGGAAACAA TCGGCTCTTTCCGTGAC
2DS4del.sub ACGTTGGATGCGGTTCAGGCAGGAGAGAAT ACGTTGGATGTTGACCACTCGTAGGGAGC CCTTGTCCTGCAGCTCC
2DS5.D1.G ACGTTGGATGACACTTTGCGCCTCATTGGAG ACGTTGGATGGTGAGTAACAGAACCGTAG GACCGATGGAGAAGTTG
2DS5.D2.G ACGTTGGATGAGGCCCATGAACGTAGGCTCC ACGTTGGATGAAGAGCCGAAGCATCTGTAG CTCCGTGGGTGGCAGGG
3DL1.TC.S ACGTTGGATGCACTGCGTTTTCACACAGAG ACGTTGGATGATGGGCAGGAGACAACTTTG AGGCCCAAGACACCCCC
3DL2.D1.G ACGTTGGATGAAGGCCAACTTCTCCATCGG ACGTTGGATGTGGGAGCTGACAACTGATAG GTGAGGAACAGAACCATA
3DL2.TC.G ACGTTGGATGGATGAACAAGACCCTCAGGAGGTG ACGTTGGATGTACACGCTGGTATCTGTT GCCTCTGAGAAGGGCGA
3DL3.D1.G ACGTTGGATGGATCACTGAGGACCCCTTGC ACGTTGGATGTCATGGGACCCATGGAATAG AATAGTTGACCTGGGAACCC
3DL3.D2.G ACGTTGGATGAGAATGTGACCTTGTCCTGC ACGTTGGATGCAGTGAGCCTAAGTTCACCG GGATAGATGGTAAATGTCAAA
3DP1.D2.G2 ACGTTGGATGTGGGAAACCTTCTCTCTCAGCC ACGTTGGATGGAGCTGCAGGACAAGGTCAC CTCTCTCAGCCCAGCCG
3DS1.3DL1.D1.S ACGTTGGATGCAAGGCCAATTTCTCCATCG ACGTTGGATGGGGAGCTGACAACTGATAGG CTGTAGGTCCCTGCAAGGGCA
3DS1.DO.S ACGTTGGATGTGTGTAGTTCCCTGCATGTG ACGTTGGATGTCATGCTATACAAAGAAGAC AGGGCTCATGTTGAAGC
3DS1.TC.S.INT ACGTTGGATGAACTGCTATGATTAGCTTC ACGTTGGATGGATGAAGGAGAAAGAAGAGGAGGA GAATGTGCAGGTGTCTG