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. Author manuscript; available in PMC: 2010 May 1.
Published in final edited form as: Anal Biochem. 2009 Feb 3;388(1):47–55. doi: 10.1016/j.ab.2009.01.033

Table 1.

Protein identities (based on mass assignment) observed in the two-step salt elution

Histone Isoform Families (based on mass assignment) observed in the two-step salt elution

Fraction 0 1 2 3 4A 4
1 15668 H1.5>22061 22774 H1.X H1.0>21296 H1.2>H1.4>20848>H1.3
2 H1.0 H1.5>22061 22774 -- H1.1>21298 H1.4>H1.2>20847
3 17322 H1.5 22773 -- -- H1.4~H1.2>H1.3>20848
4 17322 H1.5 22774 -- -- H1.4~H1.2>20848
5 -- -- 22773 -- -- H1.2<H1.4<20848
6 -- -- 22773 -- -- H1.4~H1.2>H1.3
7 -- -- -- -- -- Small peak: 22851>H1.2
8 -- -- -- -- -- Small peak: 22850
9 -- -- -- -- 22522 Small peak: 22850
10 -- -- -- -- -- --
11 -- -- -- -- -- --
12 -- -- -- -- -- --
Fraction 4B 4B′ 4C 4D 5A 5
1 13641 14441 -- 29868 16353>10901 H2B(13777)
2 13799>13673 H2B(13809) H2A(14025) H2B(13793) -- H2B(13777)
3 H2B(13809) H2B(13793) H2A(14025) H2B(13793) -- H2B(13777)
4 H2B(13809) H2B(13809) H2A(14025) H2B(13793) -- H2B(13777)≫H4(11324)
5 H2B(13809) -- H2A(14025) H2B(13793) -- H2B(13777)≫H4(11324)
6 H2B(13809) H2B(13809) H2A(14025) H2B(13793) -- H2B(13777)~H4(11324)
7 H2B(13809) H2B(13809) H2A(14025) H2B(13793) H2B13778≫H4(11325)≫22326 (H2B+Ub) H2B(13777)>22557 (H2A+Ub)
8 H2B(13809) H2B(13809) H2A(14024) H2B(13793) -- H2B(13777)
9 H2B(13808) H2B(13808) H2A(14025) H2B(13793) H2B13779<H4(11324)≫22341 (H2B+Ub) H2B(13776)≫22557 (H2A+Ub)
10 H2B(13809) H2B(13809) H2A(14024) H2B(13793) H4(11325) H2B(13777)>H4(11324)
11 H2B(13809) H2B(13825) H2A(14025) H2B(14041) H4(11325) H2B(13792)≪H4(11324)
12 H2B(13808) H2B(13825) H2A(14025) H2B(14040) -- H4(11324)
Fraction 5B 6A 6 7A 7 7B
1 -- -- H4(11308)<H2AFO -- H2A --
2 -- -- H4(11308)<H2AFO -- H2A --
3 -- -- H4(11308)<H2AFO -- H2A --
4 -- 22578 (H2A+Ub) ≪H2AFZ(13424)<H2AFO H4(11308)<H2AFO 7A(H2AFX)> 7(H2AFX) H2A(H2AFX appear) --
5 -- H2AFO H4(11308)<H2AFO -- H2A (H2AFX+Ph) --
6 -- -- H4(11308)<H2AFZ(13424) <H2AFO -- H2A --
7 -- -- H4(11308)>H2AFO -- H2A 12221>29275
8 -- -- H4(11308)>H2AFO -- 11406<H2A 11504
9 -- -- H4(11308)>H2AFO -- H2A 29275~23786
10 -- -- H4(11308)>H2AFO -- H2A --
11 H4(11324)≫22568/22614 (H2A+Ub) -- No Peak 6 -- H2A --
12 H411340≫H2AFZ(13424) -- No Peak 6 -- H2A --
Fraction 8A-12 13A 13B 14 15A 15B
1 H3 -- -- -- -- --
2 H3 -- -- -- -- --
3 H3 -- -- -- -- --
4 H3 -- -- -- -- --
5 H3 -- -- -- -- --
6 H3 -- -- -- -- --
7 H3 H3 Dimer H3 Dimer 39423 MacroH2A.1 39406 MacroH2A.1 39408
8 H3 H3 Dimer -- -- MacroH2A.1 39406 --
9 H3 -- H3 Dimer -- MacroH2A.1 39406 --
10 H3 -- H3 Dimer -- -- --
11 H3 -- H3 Dimer -- -- --
12 H3 -- -- -- -- --