Table 2.
Promoter recognition by RPOTm in vitro
| Promoter recognition RPOTm |
Promoter recognition RPOTmp |
||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| In vitro transcripti on template | ccc template | Linear template | ccc template | Linear template | |||||
| Plasmid | Promoters | −Dim1B | +Dim1B | −Dim1B | +Dim1B | −Dim1B | +Dim1B | −Dim1B | +Dim1B |
| pKL23-atp6-1 | Patp6-1-156 | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Patp6-1-200 | + | + | − | − | − | − | − | − | |
| pKL23-atp6-1-B | Patp6-1-916/913 | + | + | na | na | − | − | na | na |
| pKL23-atp6-2 | Patp6-2-436 | + | + | na | na | − | − | na | na |
| Patp6-2-507 | + | + | na | na | − | − | na | na | |
| pKL23-atp8 | Patp8-157 | − | − | − | − | − | − | na | na |
| Patp8-228/226 | + | + | − | − | − | − | na | na | |
| pKL23-atp9-B | Patp9-239 | − | − | − | − | − | − | na | na |
| Patp9-295 | + | + | − | − | − | − | na | na | |
| pKL23-atp9 | Patp9-487 | + | + | na | na | − | − | na | na |
| Patp9-652 | + | + | na | na | − | − | na | na | |
| pKL23-cox2 | Pcox2-210 | + | + | − | − | − | − | na | na |
| Pcox2-481 | + | + | − | − | − | − | na | na | |
| pKL23-rps3 | Prps3-1053 | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Prps3-1133 | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| pKL23-rrn18 | Prrn18-69 | − | − | − | − | − | − | na | ma |
| Prrn18-156 | + | + | − | − | − | − | na | na | |
| pKL23-rrn26 | Prrn26-893 | + | + | − | − | − | − | na | na |
| pKL23-trnM | PtrnM-98 | + | + | − | − | − | − | na | na |
| pKL23-trnM-B | PtrnM-574/573 | − | − | na | na | − | − | na | na |