TABLE 2.
Target gene | Primer name | Sequence (5′-3′) |
---|---|---|
16S rRNA | 16SrRNAf | CGCAGGCGGTCAGAAA |
16SrRNAr | TTCCAGAGCACACTATGGTTGAG | |
SMU.20 (mreC) | SMU20f | TCCCTGATCTAACTGTTTTGTCATCT |
SMU20r | TGTCACCCCATCATTTTTTCC | |
SMU.503c | SMU503f | TGCAGCCTGGTTTCATCCTAA |
SMU503r | TGGATAGGGATTGGGATGTGA | |
SMU.609c | SMU609f | AGAAACACCCCAAGTTGAAGTTG |
SMU609r | TTCTTTGGATTTTGCACCTTTGT | |
SMU.625 (comEA) | SMU625f | GCATGAGGGCGTCTATACTTTACC |
SMU625r | TTTGCGATCAGCCTTTTCAGA | |
SMU.910 (gtfD) | SMU910f | CAGGCAGCCAACGCATTAA |
SMU910r | AGCCCTCGCTCATCATAAGC | |
SMU.984 | SMU984f | CAACGGGTAATCAGGCAAAAG |
SMU984r | TCTACAAAAGCAAGATGACTAGAAGACTCT | |
SMU.1882c | SMU1882f | ATTATTCAAAATGGCTGGGTGAA |
SMU1882r | TTACTAAATCCTCTATTACCTTGAGCTGAGT | |
SMU.1986c (bsmH) | SMU1896f | AGACATGTTAGCCGCTGTTGAAG |
SMU1896r | AAGCGCCTGTTCCAATCGTA | |
SMU.1910c | SMU1910f | TTTTCTGTCTACTGGCCGAATG |
SMU1910r | CAAATGTATAAATGATTACCGTCTTCCT | |
SMU.1914c (bsmA) | SMU1914f | GGTGCTGGGCAAGGTTATATG |
SMU1914r | CCGATTCCTCCAGCAATAGC | |
SMU.1984 (comYC) | SMU1984f | TCAGGCTGAGCTTTATGAGCTTAA |
SMU1984r | CCTTGTATGAATTTGCCTGTTCTTG | |
SMU.2146c | SMU2146f | TCAGGAGCTTCAGGTCTCTTTCA |
SMU2146r | CCTTGGGCTTTATAAGCATTGATAG |