TABLE 3.
parC alleles of S. dysgalactiae subsp. equisimilis isolates
| Allele | No. of isolatesa | Base at nucleotide position/amino acid no.b: |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 51/17 | 54/18 | 60/20 | 69/23 | 78/26 | 100/34 | 108/36 | 111/37 | 117/39 | 141/47 | 156/52 | 207/69 | 225/75 | 235/79 | 236/79 | 237/79 | 247/83 | 248/83 | 271/91 | 279/93 | 330/110 | 339/113 | 405/135 | 417/139 | 418/140 | 420/140 | 426/142 | 432/144 | 456/152 | 459/153 | 497/166 | 513/171 | 519/173 | 540/180 | 552/184 | ||
| parC01 | 5 | T | A | C | C | A | A | G | A | T | A | T | T | A | T | C | C | G | A | A | A | T | T | A | T | C | C | T | C | G | G | G | C | T | A | T |
| parC02 | 3 | G | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| parC03 | 1 | C* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| parC04 | 4 | T* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| parC05 | 4 | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| parC06 | 1 | A* | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| parC07 | 5 | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| parC08 | 3 | T* | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| parC09 | 3 | A* | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| parC10 | 1 | G* | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| parC11 | 1 | C | G | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||
| parC12 | 1 | C | G | C | C | A* | ||||||||||||||||||||||||||||||
| parC13 | 1 | C | G | C | C | G* | ||||||||||||||||||||||||||||||
| parC14 | 4 | C | C | T | T | G | C | A | G | C | G | C | G | G* | G | C | G | |||||||||||||||||||
| parC15 | 5 | C | C | T | T | G | C | A | G | C | G | C | G | T* | G* | G | C | G | ||||||||||||||||||
| parC16 | 4 | G* | G | C | C | G | C | T* | T* | G | C | C | G | A | ||||||||||||||||||||||
| parC17 | 8 | T* | G* | G | C | C | G | C | T* | T* | G | C | C | G | A | |||||||||||||||||||||
| parC18 | 1 | C | C | T | T | G | C | A | G | C | G | C | G | G* | G | C | G | C | T* | T* | G | T | C | C | C | G | A | |||||||||
| parC19 | 1 | C | C | T | T | G | C | A | G | C | G | C | G | G* | G* | G | C | G | C | T* | T* | G | T | C | C | C | G | A | ||||||||
a
A total of 56 isolates with different levels of resistance to levofloxacin were tested.
b
Base substitutions that result in amino acid coding changes are indicated by asterisks. Nucleotide and amino acid positions are numbered according to the S. pneumoniae numbering system (36).