TABLE 2.
Grouping of CC59 isolates based on DNA microarray hybridization results
| Group and no. of isolatesa | Presence (+) or absence (−) of: |
||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| mecA | ΔmecR | ugpQ | dcs region | ccrA2 | ccrB2 | 85-2082 ccrA | MRSAZH47 ccrA | 85-2082 ccrC | blaZ | blaI | blaR | ermA | ermB | ermC | msrA | mpbBM | aphA3 | sat | tetK | pC221 cat | pC223 cat | entA | entB | entK | entQ | lukF-PV | lukS-PV | sak | |
| Group 1, “WA MRSA-73” | |||||||||||||||||||||||||||||
| 1 | + | + | + | + | + | + | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | + |
| Group 2, “WA MRSA-24” | |||||||||||||||||||||||||||||
| 3 | + | + | + | + | + | + | − | − | − | + | + | + | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | + | − | − | + |
| Group 3, “WA MRSA-55/56” | |||||||||||||||||||||||||||||
| 4 | + | + | + | + | + | + | − | − | − | + | + | + | − | + | − | − | − | + | + | + | − | − | − | + | + | + | + | + | + |
| 1 | + | + | + | + | + | + | − | − | − | + | + | + | − | + | − | − | − | + | + | + | − | + | − | + | + | + | + | + | − |
| 1 | + | + | + | + | + | + | − | − | − | + | + | + | − | + | − | − | − | + | + | − | − | + | − | + | + | + | − | − | + |
| 1 | + | + | + | + | + | + | − | − | − | + | + | + | − | + | − | − | − | + | + | − | − | + | + | + | + | + | + | + | + |
| Group 4, “WA MRSA-15” | |||||||||||||||||||||||||||||
| 7 | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | + |
| 1 | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | + | + | + | + | − | − | + |
| 1 | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + |
| Group 5, “WA MRSA-9/52,” or “Taiwan clone” | |||||||||||||||||||||||||||||
| 4 | + | − | + | − | − | − | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | + | + | + | − | + | − | − | − | − | + | + | − |
| 2 | + | − | + | − | − | − | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | + | + | + | − | − | − | + | + | + | + | + | − |
| 8 | + | − | + | − | − | − | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | + | + | + | − | + | − | + | + | + | + | + | − |
| 5 | + | − | + | − | − | − | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | + | + | − | − | + | − | + | + | + | + | + | − |
| 1 | + | − | + | − | − | − | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − |
| Group 6, “WA MRSA-9” | |||||||||||||||||||||||||||||
| 1 | + | − | + | − | − | − | + | − | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − |
| 1 | + | − | + | − | − | − | + | − | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | − | − | − |
| 1 | + | − | + | − | − | − | + | − | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | + |
| NARSA control strains, “USA1000” | |||||||||||||||||||||||||||||
| 1 (NARSA483) | + | + | + | + | + | + | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | − |
| 1 (NARSA676) | + | + | + | + | + | + | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − |
a
Group 1, PVL-negative ST59 MRSA-IVb (2B); group 2, PVL-negative ST87 (59SLV) MRSA-IVb (2B); group 3, PVL-variable ST59 MRSA-IVa, -IVd, and -IVv (2B); group 4, PVL-negative ST59 MRSA-IVa (2B&5); group 5, PVL-positive ST59/338 (59SLV)/952 (59SLV) MRSA-V (5C2&5); group 6, PVL-negative ST59 MRSA-Vv (5C2); NARSA control strains, PVL-positive ST59 MRSA-IVa (2B).