Table 1.
Gene symbol | GC % of amplicon | Amplicon length (bp) | Forward primer | Reverse primer |
---|---|---|---|---|
CCR5 | 47 | 630 | 5′-GCAGCGGCGGACCAGCCCCAAGATGCTATCT-3′ | 5′-TGGAACAAGATGGATTATCAAGTGTCAAGTCCA-3′ |
HRES1 | 81 | 488 | 5′-TCCGGCCGCGCCACCGCCACCCTCA-3′ | 5′-ACCGCCAGAGCGCCCAGCCCGCGCA-3′ |
β-Actin | 61 | 300 | 5′-CAGCGGAACCGCTCATTGCCAATGG-3′ | 5′-TCACCCACACTGTGCCCATCTACG A-3′ |
HV2S | 54 | 137 | 5′-GCTCGAGTGCGAAAAAACGTTC-3′ | 5′-TGCGGTTGATAAACGCGCAGT-3′ |
DHBVP | 44 | 690 | 5′-ATGCCCCAACAATTGAAGCAATC-3′ | 5′-ACGTCCATTGATTTTGCTGGATG-3′ |
SIM2 | 75 | 1202 | 5′-CCGTTTTCACGTGTGTGTGT-3′ | 5′-TTCCTTCTCCCTCCTGGTCT-3′ |
DIP2A | 71 | 1185 | 5′-AGGGGAAGGAAGCAGGACT-3′ | 5′-CAGCTCAGCCAGGCTCTC-3′ |
SLC19A* | 74 | 980 | 5′-CCTTCTGTTCTGTGCAGTGG-3′ | 5′-CGGACTCCGGGACTACAG-3′ |
EV107 | 40 | 189 | 5′-AGAAGATATCAGACGATCCACAATC-3′ | 5′-GTAGAACG CGCCAGAATAAGAATA-3′ |
HV2S, herpes complex virus type 2.
GenBank identification no: NT011515.