TABLE 1.

BVM phenotypic susceptibility and genotypic data for the 31 patient-derived HIV isolates

BVM FCa	Prior ARVb	Isolate no.c	Amino acid change at the indicated position in the following protein:
			Capsidd							SP1e
			357 (G)f	358 (H)	359 (K)	360 (A)	361 (R)	362 (V)	363 (L)	364 (A)	365 (E)	366 (A)	367 (M)	368 (S)	369 (Q)	370 (V)	371 (T)	372 (N)	373 (S)	374 (A)	375 (T)	376 (I)	377 (M)
0.7	Exp.	22	—j	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—
0.9	Naïve	32	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	I/V	—	G	—	—	—	—	—
1.0	Exp.	7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—
1.2	Exp.	8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—
1.2	Exp.	21	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	V	—
1.3	Exp.	26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	S	P	—	N	—	—
1.3	Exp.	28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—
1.8**	Naïve	36	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	Q	—	—	N	A	—	—
2.1*	Exp.	20	S	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	H	—	—	—	—	—	—	V	—
2.2**	Exp.	5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	H/Q	—	—	—	—	—	N	—	—
4.6*	Naïve	37	S	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	V	—
4.7**	Exp.	9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	N	V	—
5.2**	Naïve	30	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—
11**	Exp.	25	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	Delg	—	P	—	—	—	—
36**	Exp.	27	S	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A	—	—	—	—	—	—	—
>100**	Exp.	1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	C	—	A	Del	—	—	N	—	—	—
>100**	Exp.	3	S	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A	Del	H/N	—	—	—	—	—
>100**	Exp.	6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A	—	—	A	T	—	—	—
>100**	Exp.	10	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	I	Del	—	P/S	—	—	V	—
>100**	Naïve	31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A	S	A/T	—	N/T	—	V/I	—
>100**	Naïve	33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	G	—	M	—	—	T	—	—	—	—
>100**	Naïve	34	S	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A	—	T	P	—	A	—	—
>100**	Naïve	35	S	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A	Q	S	—	—	N	M	—
>100**	Naïve	38	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A/V	—	S/G	Xh	Xi	A/T	M/I	—
>100**	Exp.	23	S	—	—	—	—	I	—	—	—	—	—	—	—	A	Del	—	—	—	A	—	—
>100**	Exp.	24	—	—	—	—	—	I	—	—	—	—	—	—	—	A	Del	T	—	—	A	—	—
>100**	Exp.	12	S	—	—	—	—	I	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—
>100**	Naïve	39	S	—	—	—	—	I	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A	—	—
>100**	Exp.	2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A	G	A	—	—
>100**	Exp.	4	S	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A	—	T	N	—	—
>100**	Exp.	29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	A	—	—

^aFold change (FC) in the bevirimat EC₅₀ compared to the wild-type EC₅₀ of 34 nM against HIV-1 LAI. The statistical significance of the fold changes in the EC₅₀s compared to the wild-type EC₅₀ is expressed as P < 0.01 (**) and P < 0.05 (*). The results are the averages of at least three independent experiments.

^bARV experienced (Exp.) or naïve.

^cIsolates designated in boldface had both genotypic and phenotypic PI resistance. Data are shown in Table 2.

^dThe last 7 amino acids of the Gag-capsid protein sequences are shown.

^eThe complete amino acid sequences of Gag-SP1 are shown (14 residues).

^fThe letters in parentheses represent the wild-type sequence.

^gDel, deletion.

^hA complex S373P/T/Q/K amino acid mixture was found at that site.

ⁱA complex A374A/G/T/S amino acid mixture was found at that site.

^j—, same as wild type.