Table 2.

Univariate results by logistic regression, training and test sets combined.

	Smoothed CBS		GLAD		Unsmoothed CBS
	β	P	β	P	β	P
Height	3.95E - 01	1.16E - 20	4.88E - 01	7.93E - 27	8.88E - 01	6.47E - 117
Relative height	7.14E - 02	3.36E - 17	9.34E - 02	9.75E - 26	1.64E - 01	7.79E - 102
Break	-3.43E - 01	1.06E - 24	-3.39E - 01	2.47E - 26	-3.42E - 01	3.33E - 36
Close to other candidates	-1.19E + 00	2.17E - 32	-8.06E - 01	6.78E - 17	-1.17E + 00	1.19E - 37
Overlap with CNAs	-7.10E - 02	1.24E - 26	-6.67E - 02	6.88E - 25	-5.07E - 02	9.44E - 22
Database score	3.06E - 01	4.08E - 306	3.06E - 01	1.98E - 323	2.27E - 01	8.60E - 186
Database score II	9.79E - 03	3.19E - 159	9.35E - 03	2.16E - 167	5.90E - 03	5.25E - 74
Overlap w. other pts: %	8.89E + 00	4.98E - 254	8.02E + 00	8.64E - 276	5.45E + 00	1.71E - 158
Matching bkpt in other: %	17.31	2.58E - 276	13.13	1.11E - 246	9.14	3.62E - 178
Overlap w. other pts - GG	3.42E - 01	3.63E - 199	3.37E - 01	1.04E - 208	-1.70E - 01	6.08E - 258
LG	2.85E + 00		2.85E + 00		2.29E + 00
LL	1.68E + 00		1.73E + 00		2.13E + 00
Closeness to centromere	8.41E - 01	2.55E - 09	7.98E - 01	2.72E - 09	7.15E - 02	5.95E - 01
Closeness to telomere	4.24E - 01	2.15E - 04	5.78E - 01	2.46E - 07	-1.55E - 01	1.27E - 01
Length	-2.46E - 06	2.14E - 130	-1.78E - 06	9.65E - 94	-2.65E - 06	1.27E - 183
Dat. score of other cand.	5.98E - 02	6.69E - 17	5.45E - 02	9.41E - 14	5.17E - 02	9.02E - 11
Percent of Normal	3.40E + 00	5.29E - 59	2.70E + 00	3.35E - 50	2.78E + 00	1.72E - 60
Segmental duplication	6.81E - 01	5.71E - 11	7.16E - 01	1.51E - 13	1.79E - 01	5.85E - 02
Sign	-2.74E - 01	5.10E - 14	-2.62E - 01	2.73E - 13	-7.05E - 01	2.06E - 107
Surrounded by Normals	1.30E + 00	2.28E - 23	1.07E + 00	5.02E - 23	1.31E + 00	7.06E - 32