Table 1. PmqsRA oligonucleotides used to generate dsDNA for cocrystallization with MqsA.
Oligonucleotide† | Length | Sequence (5′→3′)‡ |
---|---|---|
F1 | 23 | TAATTAACCTTTTAGGTTATAAC |
F2 | 26 | TGTAATTAACCTTTTAGGTTATAACT |
F3 | 25 | GTAATTAACCTTTTAGGTTATAACT |
F4 | 17 | TTAACCTTTTAGGTTAT |
Fov | 24 | GCTAATTAACCTTTTAGGTTATAA |
R1 | 23 | AGTTATAACCTAAAAGGTTAATT |
R2 | 26 | AGTTATAACCTAAAAGGTTAATTACA |
R3 | 25 | GTTATAACCTAAAAGGTTAATTACA |
R4 | 23 | GTTATAACCTAAAAGGTTAATTA |
R5 | 17 | ATAACCTAAAAGGTTAA |
Rov | 24 | GCTTATAACCTAAAAGGTTAATTA |
F, forward; R, reverse; ov, the 5′-ends of the primers were engineered to include a GC overhang.
The palindromic sequence is highlighted in bold.