Skip to main content
. 2010 Jun 20;121(6):1151–1170. doi: 10.1007/s00122-010-1379-5

Table 6.

Thresholds for r 2 indicating significant LD arranged per chromosome, group and quantile according to the total distribution of r 2 for pair-wise marker combinations

Group Number of cultivars within group Number of markers per chromosome 136 55 36 80 62 84 46 26 44 46 52 53
Quantile 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
Ancient 27 0.999 0.83 0.70 0.82 0.87 0.84 0.71 0.86 0.52 0.71 0.69 0.85 0.78
0.990 0.58 0.41 0.54 0.71 0.70 0.41 0.72 0.39 0.62 0.52 0.68 0.53
0.950 0.27 0.21 0.31 0.40 0.40 0.23 0.34 0.22 0.32 0.24 0.32 0.31
Fresh consumption 102 0.999 0.48 0.54 0.51 0.71 0.84 0.60 0.76 0.28 0.72 0.77 0.62 0.58
0.990 0.17 0.22 0.26 0.55 0.67 0.15 0.51 0.22 0.29 0.54 0.36 0.41
0.950 0.07 0.08 0.08 0.18 0.36 0.07 0.17 0.10 0.10 0.26 0.09 0.13
Processing 56 0.999 0.41 0.51 0.72 0.76 0.78 0.69 0.80 0.23 0.82 0.76 0.77 0.68
0.990 0.21 0.21 0.22 0.62 0.65 0.19 0.47 0.17 0.50 0.52 0.57 0.50
0.950 0.10 0.11 0.11 0.23 0.37 0.10 0.14 0.08 0.16 0.26 0.15 0.21
Starch 44 0.999 0.77 0.55 0.40 0.72 0.83 0.51 0.67 0.69 0.74 0.43 0.83 0.79
0.990 0.43 0.29 0.26 0.52 0.62 0.24 0.41 0.20 0.52 0.29 0.49 0.54
0.950 0.16 0.15 0.13 0.20 0.30 0.13 0.19 0.12 0.18 0.15 0.16 0.22