TABLE 2.

Analysis of disomy and monosomy in spores derived from the triploid JSC2-1

	Chromosomes
Spore	I	II	III	IV	V	VI	VII	VIII	IX	X	XI	XII	XIII	XIV	XV	XVI
5a	Ja	J Y	Y	Yb	Y	S Y	S Y	J Y	S J	J	S J	Y	S	J Y	S Y	S J
5b	S Y	S	S J	S	S J	J	J	S	Y	S Y	Y	S J	J Y	S	J	Y
5c	S Y	S	S J	S	S J	J	J	S	Y	S Y	Y	S J	J Y	S	J	Y
5d	J	J Y	Y	J Y	Y	S Y	S Y	J Y	S J	J	S J	Y	S	J Y	S Y	S J
6a	J	J	Y	S	S	Ja	J	S	J Y	J	J Y	Y	Y	S Y	S	S
6b	S Y	S Y	S J	J Y	J Y	S Y	S Y	J Y	S	S Y	S	S J	S J	J	J Y	J Y
6c	J	J	Y	S	S	J	J	S	J Y	J	J Y	Y	Y	S Y	S	S
6d	S Y	S Y	S J	J Y	J Y	S Y	S Y	J Y	S	S Y	S	S J	S J	J	J Y	J Y
8a	S	S J	J Y	J Y	J	J	S	S J	Y	S Y	J	Ya	S J	S Y	S	S J
8b	J Y	Y	S	S	S Y	S Y	J Y	Y	S J	J	S Y	S J	Y	J	J Y	Y
8c	J Y	Y	S	S	S Y	S Y	J Y	Y	S J	J	S Y	S J	Y	J	J Y	Y
8d	S	S J	J Y	J Y	J	J	S	S J	Y	S Y	J	Jc	S J	S Y	S	S J
9a	Y	S J	J	S	S	S Y	S J	J	S Y	Y	S J	S J	S	S J	S Y	J Y
9b	S J	Y	S Y	J Y	J Y	J	Y	S Y	J	S J	Y	Y	J Y	Y	J	S
9c	S J	Y	S Y	J Y	J Y	J	Y	S Y	J	S J	Y	Y	J Y	Y	J	S
9d	Y	S J	J	S	S	S Y	Sb	J	S Y	Y	S J	S J	S	S J	S Y	J Y
10a	J Y	J Y	J Y	J	J Y	S	S Y	Y	J	S Y	J	S J	S	S J	J	J Y
10b	JdY	Yb	Jb	J	J Y	S	S Y	Y	J	S Y	J	S J	S	Jb	J	Yb
10c	S	S	S	S Y	S	J Y	J	S J	S Y	J	S Y	Ya	J Y	Y	S Y	S
10d	S	S	S	Yb	S	J Y	J	S J	S Y	J	S Y	Y	Yb	Y	S Y	S
11a	S Y	Y	Y	J	S Y	S	S J	Y	J	S Y	Y	Y	Y	S Y	S	J Y
11b	J	S J	S J	S Y	J	J Y	Y	S J	S Y	J	S J	S J	S J	J	J Y	S
11c	J	S J	S J	S Y	J	J Y	Y	S J	S Y	J	S J	S J	S J	J	J Y	S
11d	S Y	Y	Y	J	S Y	S	S J	Y	J	S Y	Y	Y	Y	S Y	S	J Y
12a	Y	S J	J	J	J	S Y	Y	S Y	S Y	S	S J	S	J	S Y	S Y	S J
12b	Y	S J	J	J	J	S Y	Y	Sab	S Y	S	S J	S	J	S Y	S Y	S J
12c	S J	Y	S Y	S Y	S Y	J	Sb	J	J	J Y	Y	J Y	S Sc	J	J	Y
12d	S J	Y	S Y	S Y	S Y	J	S J	J	J	J Y	Y	J Y	S Sc	J	J	Y
13a	J	S J	S	S J	S Y	Y	J Y	S J	J	S	J	S Y	S	J	S Y	S
13b	S Y	Y	J Y	Y	J	S J	S	Y	S Y	J Y	S Y	J	J Y	S Y	J	J Y
13c	S Y	Y	J Y	Y	J	S J	S	Y	S Y	J Y	S Y	Ja	J Y	S Y	J	J Y
13d	J	S J	S	S Je	S Y	Y	J Y	S J	J	S	J	S Y	S	J	Ybe	S
14a	J	Y	S J	S	Y	J	S	Y	J	J	Y	S J	S	S	S Y	S
14b	J	Y	S J	S	Y	J	S	Y	J	J	Y	S J	S	S	S Y	S
14c	S Y	S J	Y	J Y	S J	S Y	J Y	S J	S Y	S Y	S J	Y	J Y	J Y	J	J Y
14d	S Y	S J	Y	J Y	S J	S Y	J Y	S J	S Y	S Y	S J	Y	J Y	J Y	J	J Y
15a	S Y	S J	S J	Y	J	S J	S J	S	J	J	J	J Y	J Y	S Y	Y	J Y
15b	J	Y	Y	S J	S Y	Y	Y	J Y	S Y	S Y	S Y	S	S	J	S J	S
15c	J	Y	Y	S J	S Y	Y	Y	J Y	S Y	S Y	S Y	S	S	J	S J	S
15d	S Y	S J	S J	Y	J	S J	S J	S	J	J	J	J Y	J Y	S Y	Y	J Y
Averagef	6	5.9	5.9	5.8	6	6	5.8	5.9	6	6	6	6	5.9	5.9	5.9	5.9

Using SPA (described in text), we determined whether spores were monosomic or disomic, and the source of each homolog (S, S288c; J, JAY291; Y, YJM789).

^aExtra chromosome homolog detected by CGH microarrays. These extra chromosomes were not counted in the averages shown at the bottom of this table.

^bChromosome loss.

^cPutative gene conversion event.

^dBoldface indicates that homologs were detected using PCR and primers that exclusively amplified only one of the strain-specific SNPs.

^eTranslocation between chromosome IV and XV detected by CGH microarray and gel analysis.

^fAverage number of individual homologs per tetrad.