Table III. Mass isotopomer distribution of TBDMS-derivatized protein-bound amino acids (corrected).
The symbols of fragments denote the cracking patterns of TBDMS-derivatized amino acids: (M-15)+, (M-57)+, (M-85)+, (M-159)+, f302, and side chain (sc) fragments.
| Fragments | Low-Nitrogen Cultivation | High-Nitrogen Cultivation | ||||||||||||||||||
| m | m+1 | m+2 | m+3 | m+4 | m+5 | m+6 | m+7 | m+8 | m+9 | m | m+1 | m+2 | m+3 | m+4 | m+5 | m+6 | m+7 | m+8 | m+9 | |
| M_ala_057 | 0.870 | 0.047 | 0.009 | 0.073 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.863 | 0.056 | 0.016 | 0.065 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_ala_085 | 0.871 | 0.034 | 0.095 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.867 | 0.046 | 0.087 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_asx_057 | 0.746 | 0.139 | 0.088 | 0.024 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.759 | 0.140 | 0.070 | 0.028 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_asx_085 | 0.784 | 0.142 | 0.058 | 0.016 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.792 | 0.138 | 0.054 | 0.015 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_asx_302 | 0.863 | 0.085 | 0.052 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.863 | 0.084 | 0.054 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_glx_057 | 0.694 | 0.157 | 0.120 | 0.021 | 0.007 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.707 | 0.153 | 0.112 | 0.022 | 0.005 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_glx_085 | 0.726 | 0.162 | 0.090 | 0.018 | 0.004 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.740 | 0.155 | 0.090 | 0.012 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_glx_302 | 0.805 | 0.165 | 0.030 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.784 | 0.181 | 0.034 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_gly_057 | 0.904 | 0.046 | 0.050 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.913 | 0.053 | 0.034 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_gly_085 | 0.936 | 0.064 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.944 | 0.056 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_his_057 | 0.711 | 0.158 | 0.019 | 0.063 | 0.016 | 0.026 | 0.006 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.743 | 0.126 | 0.040 | 0.041 | 0.014 | 0.035 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_his_159 | 0.720 | 0.145 | 0.087 | 0.013 | 0.035 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.738 | 0.130 | 0.071 | 0.023 | 0.034 | 0.004 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_his_302 | 0.869 | 0.058 | 0.073 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.884 | 0.024 | 0.093 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_ile_015 | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | 0.686 | 0.141 | 0.112 | 0.034 | 0.015 | 0.000 | 0.012 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_ile_085 | 0.719 | 0.142 | 0.110 | 0.023 | 0.006 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.719 | 0.135 | 0.115 | 0.025 | 0.005 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_leu_015 | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | 0.721 | 0.066 | 0.179 | 0.016 | 0.013 | 0.005 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_leu_085 | 0.719 | 0.121 | 0.133 | 0.019 | 0.007 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.726 | 0.121 | 0.129 | 0.017 | 0.006 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_lys_057 | 0.648 | 0.135 | 0.084 | 0.039 | 0.014 | 0.000 | 0.080 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.699 | 0.134 | 0.091 | 0.060 | 0.011 | 0.005 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_lys_159 | 0.702 | 0.168 | 0.098 | 0.022 | 0.010 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.717 | 0.131 | 0.119 | 0.023 | 0.006 | 0.004 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_lys_302 | 0.733 | 0.249 | 0.018 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.780 | 0.202 | 0.018 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_met_057 | 0.709 | 0.185 | 0.070 | 0.025 | 0.011 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.717 | 0.174 | 0.060 | 0.034 | 0.013 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_met_085 | 0.733 | 0.184 | 0.056 | 0.023 | 0.005 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.760 | 0.160 | 0.051 | 0.028 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_phe_057 | 0.604 | 0.123 | 0.098 | 0.100 | 0.046 | 0.013 | 0.011 | 0.000 | 0.004 | 0.001 | 0.626 | 0.121 | 0.081 | 0.103 | 0.044 | 0.012 | 0.008 | 0.003 | 0.001 | 0.000 |
| M_phe_085 | 0.628 | 0.116 | 0.139 | 0.056 | 0.040 | 0.008 | 0.011 | 0.001 | 0.002 | 0.000 | 0.638 | 0.114 | 0.134 | 0.053 | 0.042 | 0.010 | 0.007 | 0.001 | 0.001 | 0.000 |
| M_phe_302 | 0.875 | 0.041 | 0.083 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.891 | 0.032 | 0.077 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_phe_sc | 0.558 | 0.181 | 0.064 | 0.052 | 0.044 | 0.024 | 0.041 | 0.035 | 0.000 | 0.000 | 0.582 | 0.164 | 0.000 | 0.095 | 0.054 | 0.048 | 0.032 | 0.025 | 0.000 | 0.000 |
| M_pro_057 | 0.748 | 0.147 | 0.104 | 0.000 | 0.000 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.743 | 0.131 | 0.099 | 0.022 | 0.004 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_pro_085 | 0.767 | 0.130 | 0.088 | 0.011 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.756 | 0.134 | 0.098 | 0.010 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_ser_057 | 0.832 | 0.099 | 0.043 | 0.026 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.849 | 0.100 | 0.034 | 0.017 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_ser_085 | 0.855 | 0.114 | 0.031 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.874 | 0.108 | 0.018 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_ser_302 | 0.895 | 0.042 | 0.063 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.901 | 0.050 | 0.049 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_thr_057 | 0.761 | 0.164 | 0.054 | 0.020 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.767 | 0.132 | 0.066 | 0.030 | 0.006 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_thr_085 | 0.726 | 0.167 | 0.093 | 0.014 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.800 | 0.132 | 0.051 | 0.017 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_thr_sc | 0.735 | 0.222 | 0.043 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.718 | 0.226 | 0.055 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_val_057 | 0.789 | 0.056 | 0.078 | 0.068 | 0.004 | 0.006 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.783 | 0.068 | 0.077 | 0.063 | 0.003 | 0.005 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_val_085 | 0.795 | 0.056 | 0.133 | 0.009 | 0.007 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.792 | 0.060 | 0.133 | 0.009 | 0.006 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_val_302 | 0.877 | 0.034 | 0.089 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.885 | 0.038 | 0.077 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| M_tyr_057 | 0.613 | 0.116 | 0.101 | 0.106 | 0.028 | 0.009 | 0.013 | 0.009 | 0.000 | 0.005 | 0.625 | 0.106 | 0.087 | 0.103 | 0.048 | 0.016 | 0.006 | 0.006 | 0.001 | 0.002 |
| M_tyr_085 | 0.610 | 0.107 | 0.136 | 0.057 | 0.049 | 0.008 | 0.001 | 0.016 | 0.015 | 0.000 | 0.602 | 0.110 | 0.135 | 0.054 | 0.041 | 0.030 | 0.010 | 0.018 | 0.001 | 0.000 |
| M_tyr_302 | 0.887 | 0.037 | 0.076 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.885 | 0.033 | 0.082 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |