Table 3.
Experimentally determined, SAR-calculated, and LOO-predicted classes of FPR1/FPR2 agonist activity for FPR1/FPR2 agonists and non-active compounds (training set) and their atom pairs used in binary classification tree analysis
| Compound | Determined | LDA | Binary Classification Tree | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Calculated | LOO-predicted | CA_12_O2 | C4_6_C4 | BR_6_C4 | BR_7_O1 | C3_9_CA | N2_3_O1 | Terminal Node | Calculated | ||
| AG-14 | FPR1 | FPR1 | FPR1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 1 | 10 | FPR1 |
| AG-26 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 7 | FPR2 |
| AG-09/1 | FPR1 | FPR1 | FPR1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 10 | FPR1 |
| AG-09/2 | FPR1 | FPR1 | FPR1 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 10 | FPR1 |
| AG-09/3 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | FPR2 |
| AG-09/4 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | FPR2 |
| AG-09/5 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 13 | FPR2 |
| AG-09/6 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 6 | 0 | 9 | FPR2 |
| AG-09/7 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 5 | 1 | 9 | FPR2 |
| AG-09/8 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 2 | 13 | FPR2 |
| AG-09/11 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/13 | FPR1 | FPR1 | FPR1 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 10 | FPR1 |
| AG-09/18 | FPR1 | FPR1 | FPR1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 10 | FPR1 |
| AG-09/19 | FPR1 | FPR1 | FPR1 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 10 | FPR1 |
| AG-09/21 | FPR1 | FPR1 | FPR2 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 10 | FPR1 |
| AG-09/25 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/26 | NA | NA | NA | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/28 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/30 | NA | NA | NA | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/36 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/37 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 7 | FPR2 |
| AG-09/38 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 7 | FPR2 |
| AG-09/41 | NA | FPR2 | FPR2 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 7 | FPR2 |
| AG-09/42 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 7 | FPR2 |
| AG-09/45 | NA | NA | NA | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/52 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/54 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/55 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/56 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/64 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/71 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/72 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/73 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | FPR2 |
| AG-09/74 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | FPR2 |
| AG-09/75 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | FPR2 |
| AG-09/76 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | FPR2 |
| AG-09/77 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | FPR2 |
| AG-09/82 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 2 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 7 | FPR2 |
| AG-09/91 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| AG-09/92 | FPR2 | FPR2 | FPR1 | 3 | 1 | 0 | 0 | 3 | 1 | 7 | FPR2 |
| AG-09/93 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 3 | 1 | 5 | FPR2 |
| AG-09/95 | NA | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 1 | 12 | NA |
| AG-09/96 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 5 | 2 | 9 | FPR2 |
| AG-09/97 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 5 | 1 | 9 | FPR2 |
| AG-09/99 | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 1 | 12 | NA |
| AG-09/101 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | 2 | 9 | FPR2 |
| AG-09/102 | NA | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 5 | 1 | 9 | FPR2 |
| C-6c | NA | NA | NA | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 12 | NA |
| C-14b | NA | NA | NA | 2 | 0 | 1 | 0 | 4 | 1 | 11 | NA |
| C-14f | FPR1 | FPR1 | FPR2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 4 | 1 | 10 | FPR1 |
| C-14m | FPR1 | FPR1 | FPR1 | 5 | 0 | 0 | 0 | 4 | 1 | 10 | FPR1 |
| C-14r | NA | NA | FPR1 | 2 | 0 | 1 | 1 | 4 | 1 | 11 | NA |
| C-14x | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 1 | 1 | 0 | 1 | 4 | 1 | 5 | FPR2 |
| C-17b | FPR1 | FPR1 | FPR2 | 2 | 0 | 0 | 1 | 4 | 1 | 10 | FPR1 |
| C-18a | NA | NA | NA | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 12 | NA |
| C-23 | NA | NA | NA | 2 | 0 | 1 | 0 | 4 | 0 | 11 | NA |
| F-5 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 6 | 1 | 9 | FPR2 |
| F-6 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 1 | 2 | 0 | 0 | 6 | 1 | 9 | FPR2 |
| F-7 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 1 | 6 | 0 | 0 | 6 | 1 | 9 | FPR2 |
| F-8 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 6 | 1 | 9 | FPR2 |
| F-9 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 9 | 1 | 9 | FPR2 |
| F-10 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 2 | 1 | 0 | 0 | 5 | 1 | 7 | FPR2 |
| F-13 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | 1 | 9 | FPR2 |
| F-14 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | 1 | 9 | FPR2 |
| F-15 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 1 | 0 | 1 | 5 | 1 | 5 | FPR2 |
| F-16 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 2 | 1 | 0 | 0 | 5 | 1 | 7 | FPR2 |
| F-17 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 5 | 1 | 9 | FPR2 |
| F-18 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 2 | 1 | 0 | 0 | 3 | 2 | 7 | FPR2 |
| S-1 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 1 | 12 | NA |
| S-2 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 5 | 1 | 9 | FPR2 |
| Quin-C1 | FPR2 | FPR2 | FPR2 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 2 | 7 | FPR2 |
ND, not determined; NA, non active. Incorrect classifications or predictions are indicated in bold italic.