Table 2.

Summary association results for 19 SNPs in HMGA2

SNP	Physical Position	Genic Position	Alleles	Unrelated Caucasians			Family-based Caucasians			Chinese
				MAF	P value	Effect size (cm)	MAF	P value	Effect size (cm)	MAF	P value	Effect size (cm)
rs7977687	64502340	5′UTR	G/A	0.041	0.171	0.975	0.045	0.133	0.485	0.196	0.120	0.647
rs2272046	64510728	intron2	G/T	0.028	0.425	0.699	0.025	0.041	0.840	0.088	0.571	0.192
rs12310312	64521025	intron3	A/G	0.045	0.084	1.172	0.062	0.030	0.619	0.212	0.029	0.524
rs2583937	64521731	intron3	C/T	0.069	0.931	0.051	0.097	0.804	0.056	0.114	0.618	0.154
rs2272047	64523002	intron3	C/T	0.049	0.084	1.147	0.058	0.027	0.641	0.211	0.030	0.241
rs2612060	64529769	intron3	G/A	0.068	0.823	0.132	0.099	0.923	0.022	0.115	0.788	0.082
rs17101839	64531835	intron3	T/C	0.024	0.115	1.500	0.049	0.023	0.754	-	-	-
rs11175944	64542662	intron3	C/G	0.064	0.045	1.149	0.089	3.65×10−3	0.693	0.211	0.018	0.566
rs7959396	64543214	intron3	C/A	0.040	0.245	0.838	0.044	0.057	0.627	0.211	0.018	0.569
rs7973574	64558999	intron3	G/A	0.028	0.520	0.555	0.046	2.49×10−3	1.141	0.036	0.412	0.434
rs10878346	64607140	intron3	A/G	0.226	0.223	0.420	0.246	1.0×10−6	0.974	0.148	0.267	0.308
rs1156095	64613521	intron3	G/A	0.167	0.638	0.185	-	-	-	0.032	0.232	0.661
rs11175973	64620042	intron3	G/T	-	-		-	-	-	-	-	-
rs1480468	64628384	intron3	A/G	-	-	-		-	-	-	-	-
rs11175978	64629135	intron3	T/C	-	-		0.052	5.0×10−6	1.993	0.092	0.025	0.763
rs1042725	64644614	3′ UTR	T/C	0.499	1.58×10−3	0.906	0.486	3.0×10−7	0.683	0.803	0.008	0.614
rs7968902	64649337	3′ UTR	T/G	0.429	1.13×10−3	0.938	0.414	3.4×10−5	0.533	0.153	0.033	0.586
rs1480464	64656838	3′downstream	T/C	0.196	0.153	0.518	0.190	0.379	0.142	0.252	0.064	0.418
rs7968682	64658147	3′downstream	G/T	0.499	1.55×10−3	0.939	0.468	2.0×10−7	0.761	0.107	0.167	0.438