Table 3.

Association analyses for alcohol dependence comorbid with drug dependence (AD+DD) for the family sample.

Starting SNPa	Minor Allele	MAFb	p-valuec
			Single SNP	3SNP-hapd	4SNP-hap	5SNP-hap
N1	T	0.25	0.24	0.024	0.082	0.026
N2	G	0.46	0.52	0.79	0.60	0.29
N3	C	0.32	0.73	0.51	0.32	0.26
N4	C	0.33	0.88	0.31	0.32	0.15
N5	C	0.22	0.75	0.52	0.26	0.050
N6	G	0.44	0.37	0.068	0.026	0.0074
N7	C	0.44	0.37	0.039	0.011	0.0014
N8	T	0.47	0.12	0.016	0.0056	0.027
N9	A	0.18	0.010	0.0040	0.0049	0.0035
N10	C	0.16	0.95	0.48	0.15	0.29
N11	C	0.37	0.34	0.34	0.49	0.65
N12	C	0.21	0.46	0.96	0.99	0.96
N13	G	0.12	0.53	0.95	1.00	0.87
N14	A	0.25	0.97	1.00	0.75	0.66
N15	G	0.13	0.77	0.94	0.56	0.53
N16	T	0.21	0.89	0.59	0.90	0.62
N17	A	0.35	0.70	0.62	0.36	0.67
N18	C	0.40	0.85	0.17	0.74	0.89
N19	A	0.33	0.68	0.42	0.60	0.080
T1	A	0.26	0.037	0.28	0.019	0.012
T2	G	0.39	0.15	0.088	0.016	0.15
T3	G	0.27	0.34	0.024	0.18	0.17
T4	G	0.40	0.36	0.11	0.11	0.079
T5	C	0.47	0.073	0.27	0.18	0.39
T6	G	0.34	0.34	0.22	0.28	0.28
T7	G	0.15	0.72	0.57	0.53	0.35
T8	T	0.15	0.40	0.70	0.34	0.17
T9	G	0.23	0.51	0.70	0.54	0.51
T10	A	0.32	0.40	0.82	0.81	0.98
A1	C	0.33	0.38	0.71	0.83	0.83
A2	A	0.32	0.94	0.76	0.24	0.066
A3	T	0.32	0.69	0.23	0.078	0.12
A4	A	0.16	1.00	0.17	0.15	0.25
A5	C	0.47	0.11	0.22	0.053	0.053
A6	G	0.31	0.073	0.12	0.027	0.037
A7	A	0.16	0.60	0.042	0.015	0.026
D1	C	0.44	0.16	0.048	0.083	0.29
D2	C	0.39	0.081	0.028	0.19	0.16
D3	A	0.14	0.28	0.069	0.11	0.0093
D4	A	0.09	0.033	0.42	0.11
D5	G	0.40	0.19	0.17
D6	T	0.45	0.21
D7	T	0.40	0.28

^aStarting SNP for the haplotype analyses.

^bMAF: minor allele frequency.

^cp-values were simulated and the significance level was set at 0.05. The grey-marked p-values are significant.

^d”hap” abbreviates ”haplotype.”