Table 3.
Distribution of Virulence-Associated Genes among 289 V. cholerae Strains Isolated from Surface Water and 35 Strains Isolated from Cholera Patients in Bangladesh
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|
Presence of virulence-associated genes and gene clustersa |
|||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Serogroup | No. of isolates | CTX | rstC | TCP | rtxA | rtxC | hlyA | mshA | VSP-1 | VSP-2 | TTSS |
| (A) Environmental isolates | |||||||||||
| O1 | 24 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |
| 2 | + | + | + | + | + | − | + | + | + | − | |
| O139 | 3 | − | − | + | + | − | − | + | + | + | − |
| 7 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | |
| 2 | + | + | + | + | + | − | + | + | + | − | |
| Non-O1, non-O139 | 2 | + | − | + | + | + | − | + | − | + | − |
| 5 | + | − | + | + | + | + | + | − | + | − | |
| 3 | + | − | + | + | + | + | + | − | − | − | |
| 10 | − | − | + | + | + | + | + | − | − | ||
| 3 | − | − | − | + | + | + | + | + | + | − | |
| 5 | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | |
| 5 | − | − | − | + | + | + | + | − | + | − | |
| 19 | − | − | − | + | + | + | + | − | − | ||
| 1 | − | − | − | − | − | + | + | − | − | + | |
| 152 | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | |
| 8 | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − | |
| 14 | − | − | − | + | − | + | + | − | − | − | |
| 9 | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | |
| 1 | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | |
| 7 | − | − | − | + | + | − | + | − | − | − | |
| 2 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | |
| 1 | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | |
| 1 | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | |
| 7 | − | − | − | + | + | − | + | − | − | − | |
| 2 | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − | |
| 1 | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | |
| 1 | − | − | − | − | + | − | + | − | − | − | |
| (B) Clinical isolates | |||||||||||
| O1 | 17 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − |
| O139 | 8 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |
| Non-O1, non-O139 | 3 | − | − | − | + | + | + | + | − | − | + |
| 3 | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | |
| 1 | − | − | − | − | + | + | + | − | − | + | |
| 1 | − | − | − | + | − | + | + | − | + | − | |
| 1 | − | − | − | + | − | + | + | − | − | − | |
| 1 | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | |
a
Presence of different genes was detected using DNA probes and PCR assays (see text for details).