Skip to main content
. 2009 Nov 9;11(6):R167. doi: 10.1186/ar2854

Table 1.

hGPI325--339-derived altered peptide ligands used in the present study

325 to 339 I W Y I N C F G C E T H A M L
APL 1 -- -- N -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
APL 2 -- -- Q -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
APL 3 -- -- S -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
APL 4 -- -- T -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
APL 5 -- -- -- Q -- -- -- -- -- -- -- --
APL 6 -- -- -- S -- -- -- -- -- -- -- --
APL 7 -- -- -- T -- -- -- -- -- -- -- --
APL 8 -- -- -- -- N -- -- -- -- -- -- --
APL 9 -- -- -- -- Q -- -- -- -- -- -- --
APL 10 -- -- -- -- S -- -- -- -- -- -- --
APL 11 -- -- -- -- T -- -- -- -- -- -- --
APL 12 -- -- -- -- -- A -- -- -- -- -- --
APL 13 -- -- -- -- -- V -- -- -- -- -- --
APL 14 -- -- -- -- -- -- N -- -- -- -- --
APL 15 -- -- -- -- -- -- Q -- -- -- -- --
APL 16 -- -- -- -- -- -- S -- -- -- -- --
APL 17 -- -- -- -- -- -- T -- -- -- -- --
APL 18 -- -- -- -- -- -- -- N -- -- -- --
APL 19 -- -- -- -- -- -- -- Q -- -- -- --
APL 20 -- -- -- -- -- -- -- S -- -- -- --

The MHC binding sites exist at glucose-6-phosphate isomerase (GPI) 328 (I), GPI 331 (F) and GPI 334 (E) as indicated (underlined). The amino acid residues of the T-cell receptor contact sites at P0 (Y327), P2 (N329), P3 (C330), P5 (G332), P6 (C333), and P8 (T335) were substituted for the indicated peptides to design 20 types of altered peptide ligands (APLs).