Table 4.

Distribution of QTLs in the RIL experiments

		Fineness	Length	Uniformity	Strength	Elongation	Color	Total
Site	Br7	9 (39)	2 (8)	1 (5)	0 (3)	3 (11)	5 (14)	20 (80)
	Br8	6 (21)	0 (4)	1 (7)	0 (4)	3 (7)	4 (12)	14 (55)
	Cs7	5 (21)	0 (2)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	5 (23)
	Cs8	3 (23)	3 (16)	3 (11)	0 (5)	2 (9)	0 (0)	11 (64)
	Cs9	9 (20)	1 (4)	3 (7)	0 (3)	0 (4)	0 (0)	13 (38)
	Ga7	7 (32)	4 (12)	3 (7)	0 (5)	1 (2)	4 (16)	19 (74)
	Ge6	4 (14)	3 (14)	0 (0)	3 (5)	0 (0)	8 (17)	18 (50)
	Lu7	9 (40)	6 (26)	0 (0)	3 (14)	0 (0)	4 (9)	22 (89)
	Lu8	5 (21)	1 (8)	1 (6)	1 (8)	3 (4)	0 (0)	11 (47)
	Mp7	3 (12)	2 (9)	0 (0)	3 (8)	0 (0)	3 (18)	11 (47)
	Mp8	6 (27)	5 (13)	2 (6)	2 (5)	4 (12)	4 (21)	23 (84)
Chromosome	1	1 (1)	1 (2)	0 (0)	0 (2)	0 (1)	2 (5)	4 (11)
	2	1 (13)	0 (5)	0 (1)	0 (0)	3 (6)	0 (0)	4 (25)
	3	1 (5)	5 (12)	0 (1)	0 (5)	0 (1)	0 (0)	6 (24)
	4	3 (7)	5 (9)	0 (0)	1 (5)	0 (0)	0 (1)	9 (22)
	5	3 (8)	0 (10)	1 (6)	0 (1)	0 (0)	1 (3)	5 (28)
	6	2 (7)	1 (1)	0 (3)	0 (3)	1 (2)	5 (11)	9 (27)
	7	0 (5)	0 (0)	0 (0)	1 (4)	0 (0)	2 (6)	3 (15)
	8	0 (2)	0 (6)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	8 (25)	8 (33)
	9	3 (24)	2 (8)	1 (4)	1 (5)	1 (4)	2 (6)	10 (51)
	10	1 (7)	0 (2)	0 (1)	0 (1)	0 (0)	0 (3)	1 (14)
	11	0 (5)	0 (4)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2 (6)	2 (15)
	12	6 (20)	0 (2)	7 (14)	2 (6)	2 (4)	0 (3)	17 (49)
	13	0 (5)	1 (3)	0 (0)	0 (1)	1 (2)	0 (0)	2 (11)
	14	0 (6)	1 (8)	0 (0)	1 (2)	0 (0)	1 (3)	3 (19)
	15	9 (27)	0 (0)	1 (4)	1 (1)	3 (10)	2 (5)	16 (47)
	16	4 (10)	0 (0)	1 (4)	0 (1)	0 (0)	0 (1)	5 (16)
	17	5 (14)	0 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (1)	5 (16)
	18	3 (14)	0 (1)	0 (0)	0 (2)	0 (1)	1 (1)	4 (19)
	19	3 (10)	2 (7)	1 (3)	2 (7)	2 (7)	0 (3)	10 (37)
	20	2 (8)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (1)	0 (1)	2 (10)
	21	5 (20)	2 (9)	0 (1)	2 (8)	2 (2)	2 (8)	13 (48)
	22	1 (8)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (3)	1 (1)	2 (12)
	23	1 (4)	0 (4)	1 (2)	0 (0)	0 (0)	0 (2)	2 (12)
	24	2 (8)	2 (7)	0 (0)	0 (1)	0 (3)	0 (0)	4 (19)
	25	7 (22)	0 (5)	0 (2)	0 (3)	0 (0)	3 (12)	10 (44)
	26	3 (10)	5 (10)	1 (3)	1 (2)	1 (2)	0 (0)	11 (27)
	Total	66 (270)	27 (116)	14 (49)	12 (60)	16 (49)	32 (107)	167 (651)

Distribution of the 167 significant QTLs (LOD > permutation based threshold) and of the total 651 QTLs (including putative QTLs of LOD > 2 shown in parentheses) from the analysis of the RIL phenotypic data and shared among the 6 fiber trait categories, 11 sites and 26 chromosomes.