Table 3.
Identification of simple sequence repeats (SSRs) from preliminary BAC-end sequence (BES) of the Camellia sinensis tea BAC library, CSBCBa.
| Sequence filename | Type | Motif | No. of repeats | SSR start | SSR end |
|---|---|---|---|---|---|
| > _camellia_g1-12-3-07_G11_.g1 | di | ac | 6 | 370 | 381 |
| > _camellia_g1-12-3-07_A01_.g1 | di | ag | 7 | 173 | 186 |
| > _camellia_g1-12-3-07_C10_.g1 | di | ag | 8 | 133 | 148 |
| > _camellia_g1-12-3-07_D02_.g1 | di | ag | 6 | 461 | 472 |
| > _camellia_g1-12-3-07_H02_.g1 | di | ag | 5 | 585 | 594 |
| > _camellia_b1-12-3-07_G05_.b1 | di | at | 5 | 306 | 315 |
| > _camellia_g1-12-3-07_C10_.g1 | di | at | 6 | 121 | 132 |
| > _camellia_g1-12-3-07_D02_.g1 | di | at | 11 | 194 | 215 |
| > _camellia_g1-12-3-07_D08_.g1 | di | at | 5 | 388 | 397 |
| > _camellia_b1-12-3-07_A03_.b1 | di | ct | 13 | 358 | 383 |
| > _camellia_b1-12-3-07_D05_.b1 | di | ct | 8 | 1 | 16 |
| > _camellia_g1-12-3-07_A06_.g1 | di | ct | 7 | 208 | 221 |
| > _camellia_g1-12-3-07_B11_.g1 | di | ct | 7 | 310 | 323 |
| > _camellia_g1-12-3-07_G11_.g1 | di | ct | 5 | 287 | 296 |
| > _camellia_g1-12-3-07_B06_.g1 | di | ga | 18 | 516 | 551 |
| > _camellia_g1-12-3-07_C10_.g1 | di | ga | 18 | 586 | 621 |
| > _camellia_g1-12-3-07_D02_.g1 | di | ga | 8 | 538 | 553 |
| > _camellia_b1-12-3-07_C09_.b1 | di | ta | 6 | 124 | 135 |
| > _camellia_b1-12-3-07_F10_.b1 | di | ta | 8 | 29 | 44 |
| > _camellia_b1-12-3-07_G12_.b1 | di | ta | 11 | 437 | 458 |
| > _camellia_g1-12-3-07_D03_.g1 | di | ta | 5 | 555 | 564 |
| > _camellia_b1-12-3-07_A03_.b1 | di | tc | 8 | 314 | 329 |
| > _camellia_g1-12-3-07_B06_.g1 | di | tg | 6 | 505 | 516 |
| > _camellia_b1-12-3-07_H09_.b1 | tri | aat | 5 | 197 | 211 |
| > _camellia_g1-12-3-07_D02_.g1 | penta | gagat | 9 | 556 | 600 |