TABLE 3.
Amino acid substitutions in the HA of H9 escape mutants
| Virus | Substitution at positiona:
|
|||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HA1
|
HA2, 15 (15) | |||||||||||
| 116 (109) | 133 (127) | 135 (129) | 145 (135) | 147 (137) | 157 (147) | 162 (152) | 189 (179) | 193 (183) | 198 (188) | 226 (216) | ||
| Sw/HK/9/98 (GenBank) | S | S | T | D | F | K | P | T | N | T | L | P |
| Sw/HK/9/98-MA | S | |||||||||||
| Sw/HK/9/98-MP | N | S | ||||||||||
| mG9-27 | N | S | ||||||||||
| m18G4 | N | S | ||||||||||
| mG1-29 | T | S | ||||||||||
| m3D11 | D | S | ||||||||||
| m7B10 | D | S | ||||||||||
| m18B1 | E | S | ||||||||||
| m18B10 | N | S | ||||||||||
| m8C4 | N | S | ||||||||||
| m19a10 | Q | S | ||||||||||
| m15F1 | L | S | ||||||||||
| m7B10-18G4 | I | K | D | S | ||||||||
| m7B10-18G4′ | K | D | S | |||||||||
| m18G4-18B1 | N | Q | S | |||||||||
| m7B10-18B10 | A | D | S | |||||||||
| m15F1-18B10 | L | T | S | |||||||||
| m15F1-3D11 | A | L | L | S | ||||||||
| m3D11-18G4 | N | D | S | |||||||||
| mG1-29-18G4 | N | T | S | |||||||||
a
Position numbers are for the H3 HA, with those for H9 HA in parentheses.