Table 4. HMM profile scores and other parameters for FlbB and FlbE orthologs.

		FlbB						FlbE
			HMM profile E values						HMM profile E values
Order	Species abbr.	Length	Full length	B1	B2	B3	B4	Length	Full length	E1	E2	E3	E4	E5	Acidic Region*
Eurotiales	Aflav	427	4.2-265	3.4-62	3.0-27	2.7-46	9.6-65	202	1.3-111	9.3-35	1.0-8	1.8-13	9.6-8	7.3-25	YES
Eurotiales	Aoryz	427	1.4-264	3.5-62	2.5-27	3.0-46	8.9-65	202	1.3-111	9.3-35	1.0-8	1.8-13	9.6-8	7.3-25	YES
Eurotiales	Aterr	434	1.3-254	8.7-62	5.6-28	4.1-46	5.2-62	226	9.1-115	2.3-35	4.4-8	2.4-13	7.0-8	9.5-25	YES
Eurotiales	Anige	420	1.2-252	6.8-62	1.4-27	1.2-45	8.3-64	203	7.6-111	3.5-35	5.4-8	4.0-14	5.8-8	4.0-25	YES
Eurotiales	Afumi	420	8.4-251	1.7-60	9.6-28	2.9-46	9.2-65	222	2.2-118	2.5-35	2.2-9	1.6-13	5.8-8	1.2-24	YES
Eurotiales	Nfisc	391	4.1-244	6.9-61	7.0-28	5.0-46	1.1-64	222	2.4-118	5.7-35	2.2-9	1.6-13	5.7-8	1.5-24	YES
Eurotiales	Anidu	426	1.5-235	2.6-59	3.2-25	2.7-45	2.1-61	201	2.2-104	6.4-35	2.2-8	1.6-13	9.4-8	9.4-24	YES
Eurotiales	Aclav	397	7.8-241	1.5-60	3.5-23	6.0-46	1.6-64	205	5.4-115	1.2-34	2.3-9	3.2-14	4.9-8	9.7-25	YES
Eurotiales	Pchry	410	8.0-230	3.8-57	9.0-25	9.1-46	1.3-60	280	1.7-104	4.5-34	1.2-7	8.2-13	9.4-8	1.3-21	YES
Onygenales	Cposa	434	2.3-143	3.6-47		6.7-25	3.0-44	187	1.3-65	4.2-17		1.2-9	6.6-5	6.6-17	YES
Onygenales	Cimmi	434	2.5-143	3.6-47		6.6-25	3.0-44	187	1.7-65	4.8-17		1.2-9	6.5-5	6.6-17	YES
Eurotiales	Pmarn	431	1.0-136	1.6-43		7.4-26	8.4-48	208	3.8-63	4.5-20		6.0-8	2.2-4	1.4-17	YES
Eurotiales	Tstip	421	6.5-143	1.9-45	2.2-3	1.3-27	9.1-47	217	1.0-65	6.2-21		5.8-8	1.3-4	9.5-19	YES
Onygenales	Mcani	417	2.0-130	7.2-44		1.6-21	4.9-41	208	1.1-54	2.7-14		1.5-9		2.4-17	YES
Onygenales	Pb-01	408	4.6-136	6.5-46		2.0-23	1.8-45	180	3.1-57	9.6-16		9.9-9	4.5-8	1.2−11
Onygenales	Pb-03	410	1.7−134	2.4−45		2.0−23	1.9−45	180	1.6−58	1.7−15		3.5−10	4.5−8	1.2−11
Onygenales	Abenh	384	1.1−127	2.5−44		2.1−19	3.3−42	222	3.9−52	2.0−14		1.5−9		1.4−16	YES
Onygenales	Aderm	424	1.5−131	3.9−42		3.8−21	1.2−47	201	1.6−59	1.4−16		1.6−10	3.7−8	2.5−12	YES
Onygenales	Tverr	409	5.0−129	2.6−44		8.1−20	3.7−42	208	2.8−51	1.8−14		9.1−7		2.3−15	YES
Onygenales	Ttons	429	1.6−128	1.0−44		1.8−19	1.9−41	207	2.1−52	1.8−14		1.3−9		3.6−15	YES
Onygenales	Mgyps	446	6.7−133	1.6−46		2.2−20	1.8−42	208	5.2−52	1.9−14		2.6−8		3.0−16	YES
Onygenales	Trubr	429	5.8−129	2.5−44		3.3−20	2.4−42	208	9.0−52	1.6−14		1.3−9		2.5−14	YES
Dothideomycetes	Chete	354	2.5−86	1.4−34		5.1−15	2.6−27	237	1.3−43	1.5−14		1.2−10		2.8−14
Dothideomycetes	Ptrit	389	3.3−85	1.3−34		3.2−15	1.9−26	238	1.7−49	4.8−14		7.3−12		3.3−15
Dothideomycetes	Snodo	405	2.4−84	6.7−36		3.6−15	2.9−26	242	2.0−46	2.1−14		3.3−12		4.6−15
Dothideomycetes	Mgram	380	4.1−73	3.3−34		3.8−13	1.6−20	213	1.3−47	2.7−16		1.5−10	1.1−4	2.4−8	YES
Sordariomycetes	Tvire	358	2.3−73	2.4−33		5.7−13	1.6−23	269	9.2−28	7.3−9				1.7−7	YES
Sordariomycetes	Ndisc	422	2.0−69	3.8−32		1.0−14	4.0−22	1014	5.5−20	8.1−9			2.2−4	2.1−8	YES
Sordariomycetes	Tterr	427	6.0−72	1.8−33		2.2−11	8.0−21	524	5.2−21	6.6−11			8.6−5	3.9−8
Sordariomycetes	Vdahl	382	1.1−67	1.6−34		8.9−8	2.5−23	383	2.0−25	8.9−12				4.9−8
Sordariomycetes	Ncras	365	2.2−68	5.9−32		5.1−14	1.5−22	1001	6.0−20	2.0−9			2.1−4	2.5−8	YES
Sordariomycetes	Tatro	351	9.2−75	1.0−33		4.8−13	9.1−24	269	1.1−28	1.5−9				2.3−10	YES
Sordariomycetes	Ntetr	366	6.1−69	1.2−32		5.2−14	2.9−22	990	1.1−21	2.0−9			2.1−4	2.4−8	YES
Leotiomycetes	Sscle	386	2.9−73	8.4−32		1.1−16	2.1−21	249	2.9−20	1.1−12		5.4−4
Sordariomycetes	Foxys	362	5.1−67	2.6−31		5.2−12	7.2−22	832	5.3−18	5.5−10					YES
Sordariomycetes	Fgram	361	2.5−67	3.0−31		4.8−12	4.1−22	836	1.3−19	6.2−10					YES
Sordariomycetes	Trees	367	1.9−70	1.0−33		8.5−13	6.2−22	274	2.9−28	4.2−8				1.4−7	YES
Sordariomycetes	Fvert	359	1.8−67	2.9−31		6.5−12	2.4−22	722	1.3−18	4.6−10					YES
Dothideomycetes	Mfiji	368	5.9−70	5.5−33		1.5−11	1.2−19	195	6.6−47	5.9−16		2.8−11	1.1−4	8.4−13
Sordariomycetes	Moryz	380	5.2−61	6.5−30		8.2−6	3.5−21	294	4.3−20	6.7−9					YES

*YES indicates acidic region of FlbE is present. The nine orthologs used for motif discovery are in bold.