TABLE 2.
Characterization of the 28 E. coli strains isolated from raw-milk cheeses
| Strain | Isolationa | Serotypeb | Presence off: |
||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| stx (subtypec) | eae (type) | Hemo- lysise | EHEC-hlyA | katP | espP | nleA | pagC | ent | efa1 | saa | EAF | bfpA | |||
| STEC | |||||||||||||||
| 33.1 | C | O2:H27 | + (stx2a) | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 162.5 | C | O2:H27 | + (stx2a) | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 246.3 | C | O2:H27 | + (stx2a) | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 104.5 | C | O8:H19 | + (stx2a + stx2d) | − | E-hly | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 303.1 | C | O8:H19 | + (stx2ND) | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 170.2 | I, C | O26:H11 | + (stx1a) | + (β1) | E-hly | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − |
| 238.2 | I | O26:H11 | + (stx1a) | + (β1) | E-hly | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − |
| 129.2 | I | O26:[H11] | + (stx1a) | + (β1) | E-hly | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − |
| 245.3 | I | O26:[H11] | + (stx1a) | + (β1) | E-hly | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − |
| 260.3 | I | O26:[H11] | + (stx1a) | + (β1) | E-hly | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − |
| 283.4 | I | O26:[H11] | + (stx1a) | + (β1) | E-hly | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − |
| 277.2 | I | O26:[H11] | + (stx1a + stx2a) | + (β1) | E-hly | + | + | − | + | − | + | + | − | − | − |
| 161.2 | C | O91:H10 | + (stx2d) | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 282.2 | C | O128ab:[H2] | + (stx1c) | − | E-hly | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 124.1 | C | O166:[H28]d | + (stx2b + stx2c) | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 91.1 | C | O174:H2 | + (stx1a) | − | E-hly | + | − | + | − | + | − | − | + | − | − |
| 299.3 | C | O175:H16 | + (stx2a) | − | E-hly | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − |
| 311.2 | C | O175:H16 | + (stx2d) | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 381.1 | C | O178:H19 | + (stx2c) | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − |
| 225.4 | C | ONT:H10 | + (stx1c) | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 47.1 | C | Or:H10 | + (stx1c) | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 180.E | C | Or:H10 | + (stx1c) | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| Non-STEC | |||||||||||||||
| 04.2 | I | O26:[H11] | − | + (β1) | α-hly | − | − | − | + | − | + | + | − | − | − |
| 315.2 | I | O26:[H11] | − | + (β1) | α-hly | − | − | − | + | − | + | + | − | − | − |
| 306.D | I | [O26]:[H11] | − | + (β1) | α-hly | − | − | − | + | − | + | + | − | − | − |
| 355.2 | I | O26:H32 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 167.2 | I | O103:H25 | − | + (γ2/θ) | E-hly | + | − | − | − | + | + | + | − | − | − |
| 275.1 | C | O133:H29d | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
C, colony hybridization; I, immunomagnetic separation.
Or, O rough. O and H types in brackets represent strains whose serotype could be determined by real-time PCR only and not by conventional serotyping.
stx subtypes refer to prototype organisms (GenBank accession numbers in parentheses) as follows: stx1a, O157-EDL933 (M19473); stx1c, O174-DG131-3 (Z36901); stx2a, O157-EDL933 (X07865); stx2b, O118-EH250 (AF043627); stx2c, O157-E32511 (M59432); stx2d, O73-C165-02 (DQ059012); ND, not determined.
These strains tested positive for ihp1O145 by real-time PCR.
E-hly and α-hly, EHEC hemolytic and alpha-hemolytic phenotypes on red blood cell agar, respectively.
+, present; −, absent.