Table 5.
Primers used in RT-PCR and quantitative real-time PCR
| Primera | Sequence |
|---|---|
| CaHap43-probe1-1 | 5′-ACTCCAGCGTCGAAAAGAAA-3′ |
| CaHap43-probe1-2 | 5′-TGATTGGTGAGGGTTGTTCA-3′ |
| CaSfu1-probe1-1 | 5′-GAAATCACCGCACACAACAC-3′ |
| CaSfu1-probe1-2 | 5′-ACGATGATTGCATTGGTGAA-3′ |
| CaEFB1-1 | 5′-ATTGAACGAATTCTTGGCTGAC-3′ |
| CaEFB1-2 | 5′-CATCTTCTTCAACAGCAGCTTG-3′ |
| CaAct1-q1-1 | 5′-GCCCAATCCAAAAGAGGTAT-3′ |
| CaAct1-q1-2 | 5′-AGCTTCGGTCAACAAAACTG-3′ |
| CaAco1-q1-1 | 5′-TTCCCATTCAACGACTCAAT-3′ |
| CaAco1-q1-2 | 5′-GTGGTTCCAAGGTGTTCAAG-3′ |
| CaSDH2-q1-1 | 5′-TGGAACCCAGATACTCCAGA-3′ |
| CaSDH2-q1-2 | 5′-AAGCCAATGTGTTTCTTCCA-3′ |
| CaCYC1-q1-1 | 5′-AAAAAGGTGGTCCACACAAA-3′ |
| CaCYC1-q1-2 | 5′-TTAAACCACCAAAAGCCATT-3′ |
| CaCCP1-q1-1 | 5′-GGGTGGATCATATGGTGGTA-3′ |
| CaCCP1-q1-2 | 5′-GTACAGCAGCAACACCTCCT-3′ |
| CaYHB1-q2-1 | 5′-TTGGAAGCTTGGACTATTGC-3′ |
| CaYHB1-q2-2 | 5′-CGTTCAGGTTTTGGTAATGG-3′ |
| CaATM1-q1-1 | 5′-GCCTCAAGAAACCCCATTAT-3′ |
| CaATM1-q1-2 | 5′-TCCCTCGTTCTCCAACAATA-3′ |
| CaISA1-q1-1 | 5′-CCGACCGACAGTAACAAATC-3′ |
| CaISA1-q1-2 | 5′-CGAATCAATTTTGGATCAGG-3′ |
| CaISU1-q1-1 | 5′-CGCTAAAGAGTTGAGCTTGC-3′ |
| CaISU1-q1-2 | 5′-CGGCACTAGCACTTGAACTT-3′ |
| CaYAH1-q1-1 | 5′-ACATTGCGAGCTTTCCATAC-3′ |
| CaYAH1-q1-2 | 5′-ACATGAACCACCACAAGCTC-3′ |
| CaFRP1-q1-1 | 5′-TTCGGTGGTGATACCTGTCT-3′ |
| CaFRP1-q1-2 | 5′-CCCCACTTTCAGCAAGACTA-3′ |
a
-1, forward primer; -2, reverse primer.