Table 2.
Detection of RD2 element genes in Lancefield group C and G streptococci by PCR.
| A. Detection of genes encoding putative extracellular proteins | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Strain | M28_ Spy1306 | M28_ Spy1307 | M28_ Spy1308 | M28_ Spy1325 | M28_ Spy1326 | M28_ Spy1332 | M28_ Spy1336 | ||||||
| GCS | |||||||||||||
| 15169 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15170 | + | + | - | - | + | - | - | ||||||
| 15172 | + | + | + | + | + | - | + | ||||||
| 15173 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15178 | + | + | + | + | + | + | + | ||||||
| 15181 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| GGS | |||||||||||||
| 15163 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15164 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15165 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15166 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15167 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15168 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15171 | + | + | + | + | + | - | + | ||||||
| 15174 | + | + | + | + | + | + | + | ||||||
| 15175 | + | + | + | - | - | - | - | ||||||
| 15176 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15177 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15179 | + | + | - | + | + | - | + | ||||||
| 15180 | + | + | + | + | + | - | + | ||||||
| 15182 | + | + | + | + | + | + | + | ||||||
| B. PCR-tiling across the entire RD2 element. Example of the tiling across RD2 is presented in Figure 3. (+) PCR product present, (-) no product, * amplified fragment of different size than for strain MGAS6180 | |||||||||||||
| PCR-tiling fragment no. | |||||||||||||
| Strain | group | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 |
| 6180 | A | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| 15178 | C | - | + | + | + | + | - | - | + | - | - | + | - |
| 15174 | G | +(*) | + | + | + | + | + | - | + | + | + | + | - |
| 15182 | G | - | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | - |