Skip to main content
. 2011 May 9;6(5):e19328. doi: 10.1371/journal.pone.0019328

Table 5. Ratio of non-synonymous (dN) and synonymous (dS) substitutions of RXLR genes.

Gene No seq. dN dS dN/dS Z-statistic P-value
RXLR3 6 0,026 0,011 2,4 1,6 0,06
RXLR4 2 0 0 - - -
RXLR5 7 0 0,001 - - -
RXLR6 8 0,006 0,007 0,9 -0,3 1
RXLR7 7 0,0012 0 - - -
RXLR9 8 0,071 0,023 3,1 3,5 0,0004
RXLR13 7 0,025 0,006 4,2 3,9 0,0001
RXLR15 8 0,002 0 - - -
RXLR16 8 0,103 0,041 2,5 4,8 0,000002
RXLR17 7 0,008 0,003 2,7 1,3 0,103
RXLR18 8 0,001 0,003 0,3 -0,8 1
RXLR19 7 0,055 0,03 1,8 2,7 0,004
RXLR20 8 0,007 0,013 0,5 -0,9 1
RXLR21 8 0,009 0,012 0,8 -0,3 1
RXLR23 8 0,025 0,007 3,6 3,2 0,001
RXLR29 8 0,03 0,021 1,4 0,9 0,19

Nucleotide sequences obtained for each RXLR candidate of Hpa isolates were used to calculate the ratio dN/dS. Genes under positive selection exhibit a dN/dS ratio higher than 1 and a P-value <0.005 (in bold).