Table 3.
Identification of fungi isolated from indoor air by the array and by sequence analysis of the ITS and D1/D2 domain
| Strain no.a | Species identification by | |||
|---|---|---|---|---|
| Array hybridization | ITS sequence (%)a | D1/D2 sequence (%)a | Best match | |
| 1 | Cladosporium cladosporioides | Cladosporium cladosporioides (99.4) | Cladosporium cladosporioides (99.6) | Cladosporium cladosporioides |
| 3 | Aspergillus versicolor | Aspergillus versicolor (100) | Aspergillus versicolor (99.0) | Aspergillus versicolor |
| 5 | Aspergillus niger | Aspergillus niger (100) | Aspergillus niger (100) | Aspergillus niger |
| 12 | Acremonium strictumb | Acremonium implicatum (100) | Acremonium sp. (97.8) | Acremonium implicatum |
| 13 | Cladosporium cladosporioides | Cladosporium cladosporioides (100) | Cladosporium cladosporioides (100) | Cladosporium cladosporioides |
| 28 | Alternaria alternata | Alternaria alternata (100) | Alternaria alternata (98.6) | Alternaria alternata |
| 33 | Aureobasidium pullulans | Aureobasidium pullulans (100) | Aureobasidium pullulans (98.2) | Aureobasidium pullulans |
| 35 | Aspergillus flavus | Aspergillus flavus (100) | Aspergillus flavus (100) | Aspergillus flavus |
| 38 | Aspergillus flavus | Aspergillus flavus (99.8) | Aspergillus flavus (99.8) | Aspergillus flavus |
| 41 | Cladosporium cladosporioides | Cladosporium cladosporioides (100) | Cladosporium cladosporioides (99.6) | Cladosporium cladosporioides |
| 42 | Cladosporium cladosporioides | Cladosporium cladosporioides (99.8) | Cladosporium cladosporioides (99.8) | Cladosporium cladosporioides |
| 43 | Cladosporium cladosporioides | Cladosporium cladosporioides (100) | Cladosporium cladosporioides (99.8) | Cladosporium cladosporioides |
| 44 | Cladosporium cladosporioides | Cladosporium cladosporioides (100) | Cladosporium cladosporioides (100) | Cladosporium cladosporioides |
| 45 | Cladosporium cladosporioides | Cladosporium cladosporioides (100) | Cladosporium cladosporioides (99.6) | Cladosporium cladosporioides |
| 47 | Cladosporium cladosporioides | Cladosporium cladosporioides (100) | Cladosporium cladosporioides (99.6) | Cladosporium cladosporioides |
| 48 | Cladosporium cladosporioides | Cladosporium cladosporioides (100) | Cladosporium cladosporioides (99.6) | Cladosporium cladosporioides |
| 49 | Aspergillus versicolor | Aspergillus versicolor (99.8) | Aspergillus versicolor (99.3) | Aspergillus versicolor |
| 50 | Aspergillus versicolor | Aspergillus versicolor (100) | Aspergillus versicolor (99.3) | Aspergillus versicolor |
| 52 | Aspergillus versicolor | Aspergillus versicolor (99.8) | Aspergillus versicolor (99.1) | Aspergillus versicolor |
| 55 | Aspergillus versicolor | Aspergillus versicolor (100) | Aspergillus versicolor (99.8) | Aspergillus versicolor |
| 56 | Aspergillus versicolor | Aspergillus versicolor (100) | Aspergillus versicolor (98.6) | Aspergillus versicolor |
| 58 | Aspergillus versicolor | Aspergillus versicolor (100) | Aspergillus versicolor (99.1) | Aspergillus versicolor |
| 59 | Aspergillus versicolor | Aspergillus versicolor (100) | Aspergillus versicolor (99.3) | Aspergillus versicolor |
| 60 | Aspergillus versicolor | Aspergillus versicolor (100) | Aspergillus versicolor (99.1) | Aspergillus versicolor |
| 64 | Aspergillus niger | Aspergillus niger (99.8) | Aspergillus niger (99.1) | Aspergillus niger |
| 67 | Aspergillus niger | Aspergillus niger (99.8) | Aspergillus niger (99.6) | Aspergillus niger |
| 68 | Aspergillus niger | Aspergillus niger (99.8) | Aspergillus niger (100) | Aspergillus niger |
aValues in parentheses are percentages of sequence similarities of the test isolates with the best-scoring sequences in the GenBank database.
bThe strain was misidentified by array hybridization.