Table 4.
Contingency Table of Calculated and True Partitions
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | Total | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 636 | 1 | 1 | 5 | 643 | |||||||||||
2 | 1 | 237 | 1 | 2 | 241 | |||||||||||
3 | 1 | 229 | 1 | 1 | 232 | |||||||||||
4 | 1 | 203 | 1 | 205 | ||||||||||||
5 | 176 | 176 | ||||||||||||||
6 | 99 | 99 | ||||||||||||||
7 | 1 | 1 | 84 | 86 | ||||||||||||
8 | 77 | 77 | ||||||||||||||
9 | 1 | 7 | 1 | 1 | 66 | 76 | ||||||||||
10 | 4 | 22 | 26 | |||||||||||||
11 | 24 | 24 | ||||||||||||||
12 | 1 | 22 | 23 | |||||||||||||
13 | 20 | 20 | ||||||||||||||
14 | 10 | 1 | 1 | 1 | 2 | 15 | ||||||||||
15 | 12 | 1 | 1 | 14 | ||||||||||||
16 | 8 | 8 | ||||||||||||||
17 | 4 | 4 | ||||||||||||||
18 | 3 | 1 | 4 | |||||||||||||
19 | 3 | 3 | ||||||||||||||
20 | 2 | 2 | ||||||||||||||
21 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||
22 | 2 | 2 | ||||||||||||||
23 | 2 | 2 | ||||||||||||||
24(*) | 10 | 6 | 5 | 1 | 4 | 3 | 4 | 5 | 4 | 3 | 45 | |||||
Total | 669 | 274 | 254 | 207 | 183 | 100 | 85 | 82 | 67 | 32 | 28 | 26 | 12 | 8 | 2 | 2029 |
Rows correspond to calculated clusters; columns correspond to true clusters. We observe a high proportion of pure calculated clusters. Only two clusters (cluster 14 and cluster 21) have a purity below 70%. Cluster 24 is marked (*). It contains singletons, i.e., clone fingerprints that have not been assigned to any of the clusters. False assignment to singletons happened in 45 cases (2.2%).