Table 4.
The 162 variable nucleotide positions of the 667-bp cytochrome c oxidase sequence
| Collection | Nucleotide position | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Series | Location | Sequence name | 22 | 25 | 34 | 38 | 40 | 43 | 46 | 49 | 50 | 58 | 67 | 70 | 79 | 82 | 85 | 91 | 92 | 103 | 106 | 109 | 115 | 121 | 127 | 130 | 133 | 139 | 145 | 154 | 157 | 160 | 163 | 166 | 181 | 184 | 193 | 197 | 199 | 202 | 205 | 206 | 208 | 211 | 212 | 214 | 217 | 220 | 226 | 229 | 232 | 235 | 238 | 253 | 256 | 263 | 266 | 268 | 271 | 274 | 277 | 283 | 284 | 286 | 287 | 289 | 295 | 298 | 301 | 307 | 313 | 316 | 322 | 325 | 328 | 334 | 337 | 343 | 346 | 349 | 352 | 355 | 361 | 362 | 364 | 369 | 370 | 373 | 376 | 379 | 382 | 386 | 388 | 391 | 397 | 400 | 401 | 403 | 407 | 415 | 418 | 421 | 424 | 428 | 430 | 433 | 436 | 442 | 451 | 466 | 475 | 478 | 481 | 482 | 484 | 485 | 490 | 496 | 499 | 500 | 508 | 514 | 517 | 520 | 523 | 526 | 529 | 532 | 533 | 535 | 536 | 538 | 539 | 541 | 547 | 550 | 553 | 556 | 562 | 565 | 568 | 574 | 578 | 580 | 586 | 589 | 595 | 596 | 601 | 604 | 607 | 610 | 613 | 616 | 619 | 622 | 628 | 631 | 634 |
| Verrucarum | Amazonas | Ama02 | A | C | T | G | A | A | T | T | T | T | A | T | G | T | C | T | T | T | T | A | T | A | T | A | T | T | T | T | T | A | A | A | A | A | C | C | T | T | T | T | A | A | C | T | A | C | T | A | A | T | T | A | C | T | C | T | T | T | T | C | C | T | C | C | A | C | A | A | T | A | A | T | T | T | T | C | T | A | T | T | T | G | T | G | A | A | T | A | T | C | T | A | C | T | T | A | T | A | T | T | A | C | T | A | T | C | A | A | A | G | T | A | T | T | T | A | C | T | T | T | T | A | T | A | T | A | T | A | T | A | C | A | T | T | T | T | A | A | T | A | C | T | T | T | T | T | T | C | A | C | T | C | T | A | A | A | C |
| Verrucarum | Amazonas | Ama06 | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Amazonas | Ama10 | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Amazonas | Ama11 | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Amazonas | Ama14 | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Cajamarca | Caj01 | G | · | · | · | · | G | · | · | C | C | · | · | T | C | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | G | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Cajamarca | Caj07 | G | · | C | · | · | G | · | · | C | C | · | · | T | C | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | G | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Cajamarca | Caj09 | G | · | · | · | · | · | · | · | C | C | · | · | T | C | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | G | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Cajamarca | Caja05 | G | · | · | · | · | G | · | · | C | C | · | · | T | C | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | G | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Piura | Piu02 | · | · | · | · | · | G | C | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | C | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Piura | Piu17 | · | · | · | · | · | G | C | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Piura | Piu22 | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | G | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Conchucos | Hnco02 | G | · | C | · | · | G | · | · | C | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | G | T |
| Verrucarum | Conchucos | Sihua07 | · | · | · | · | · | G | · | · | C | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | A | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Conchucos | Chngas11 | · | · | · | · | · | G | · | · | C | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | G | T |
| Verrucarum | Conchucos | Masn17 | · | · | · | · | · | G | · | · | C | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | G | T |
| Verrucarum | Conchucos | Lverru | G | · | C | · | · | G | · | · | C | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | G | G | T |
| Verrucarum | Conchucos | Lverru2 | G | · | C | · | · | G | · | · | C | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | G | T |
| Verrucarum | Purisima | Casma01 | · | · | G | · | · | G | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | G | G | · | · |
| Verrucarum | Purisima | Yumpe15 | · | · | A | · | · | G | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | G | G | · | · |
| Verrucarum | Purisima | Yuram01 | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | G | · | · |
| Verrucarum | Purisima | Yuram02 | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · |
| Verrucarum | Purisima | Maya2883 | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | G | · | · |
| Verrucarum | Purisima | Shan06 | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | G | · | · |
| Verrucarum | Huancavelica | Huan811 | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | G | G | · | T |
| Verrucarum | Lima | Lim04 | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | G | · | · | T |
| Verrucarum | Lima | Lim05 | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | G | G | · | T |
| Verrucarum | Lima | Lim07 | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | G | · | · | T |
| Verrucarum | Lima | Lim17 | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | G | G | · | T |
| Verrucarum | Lima | Lim28 | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | T | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | G | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | T | · | · | G | · | T |
| Verrucarum | Colombia | Landina | G | · | A | · | C | T | C | · | · | · | · | · | C | C | A | · | · | C | C | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | T | · | · | C | · | T | A | C | · | C | · | · | · | · | G | T | · | · | · | C | C | · | T | · | · | · | · | · | · | T | T | A | · | · | · | A | · | T | · | · | G | A | A | · | A | · | A | · | A | · | · | · | C | · | · | · | A | · | · | T | A | · | · | C | C | T | · | G | · | C | · | · | · | · | · | T | T | · | C | A | C | · | C | · | C | · | T | · | C | A | · | · | · | · | A | T | · | · | C | T | · | · | C | A | · | · | · | · | A | T | · | · | · | C | · | · | · | T | · | T | · | · | · | · | · | · | · |
| Verrucarum | Colombia | Lnevesi | · | · | A | · | · | · | C | C | · | · | T | A | T | · | T | · | · | · | C | G | · | · | · | · | A | C | A | · | · | · | T | G | T | · | · | T | A | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | C | T | A | · | · | A | A | · | · | · | T | T | T | T | T | A | · | · | · | A | A | · | · | · | T | · | A | · | · | · | · | T | · | · | T | · | · | · | · | · | A | C | T | C | G | C | · | T | T | A | · | A | T | · | · | · | A | · | · | · | C | C | · | T | · | C | A | A | · | · | T | A | T | · | · | C | T | · | T | · | A | · | G | T | · | · | C | · | · | A | · | · | · | · | A | C | · | · | · | A | · | G | · | · |
| Townsendi | Colombia | Llongifl | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | A | A | C | A | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | C | · | · | · | · | · | T | T | A | · | · | · | · | · | T | A | · | · | · | G | T | C | · | · | A | · | T | A | C | C | · | A | T | A | · | T | · | · | · | T | · | G | G | · | · | A | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | C | T | A | · | T | · | · | · | · | T | · | C | T | T | A | G | C | T | T | · | · | A | · | · | · | · | · | · | T | · | A | · | · | T | · | T | · | C | C | T | C | C | T | · | C | G | · | · | T | G | · | T | T | A | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | C | G | · | · |
| Townsendi | Colombia | Llongifl2 | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | A | A | C | A | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | C | · | · | · | · | G | T | T | A | · | · | · | · | · | T | A | G | · | · | G | T | C | · | · | A | · | T | A | C | C | · | A | T | A | · | T | · | · | · | T | · | G | · | · | · | A | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | C | · | · | T | A | · | T | · | · | · | · | T | · | C | T | T | A | G | C | T | T | · | · | A | · | · | · | · | · | · | T | · | G | · | · | T | · | T | · | C | C | T | C | C | T | · | C | G | · | · | T | G | · | T | T | A | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | C | G | · | · |
| Townsendi | Colombia | Lsauroida | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | A | A | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | C | · | · | · | · | G | T | T | A | · | · | · | · | · | T | A | G | · | · | G | T | C | · | · | A | · | T | A | C | C | · | · | T | A | · | T | · | · | · | T | · | G | G | · | · | A | · | · | · | T | · | · | · | · | · | A | · | · | C | · | C | T | A | · | T | · | · | · | · | T | · | C | T | T | A | G | C | T | T | · | · | A | · | · | · | · | · | · | T | · | A | · | · | T | · | T | · | C | C | T | C | C | T | · | C | G | · | · | T | · | · | T | T | A | · | · | · | · | · | · | C | · | · | · | · | C | G | · | · |
| Townsendi | Colombia | Lyoungi | G | · | · | · | · | G | · | A | · | C | · | A | T | C | A | C | · | · | · | · | · | · | G | T | · | · | · | C | C | G | · | · | · | · | T | T | A | · | · | · | · | · | T | A | G | · | · | · | T | · | · | · | A | C | T | A | · | · | · | A | T | A | · | T | · | T | · | T | · | G | · | · | · | A | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | A | · | T | · | · | · | · | T | · | A | T | T | A | · | · | T | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | T | C | A | · | · | C | · | T | · | C | C | · | C | C | T | · | C | A | · | · | T | · | C | T | T | A | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | G | · | · | · | · |
| Townsendi | Colombia | Lyoungi2 | G | · | · | · | · | G | · | A | · | C | · | A | T | C | A | C | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | C | C | G | · | · | · | · | T | T | A | · | · | · | · | · | T | A | G | · | · | · | T | · | · | · | A | C | T | A | · | · | · | A | T | A | · | T | · | T | · | T | · | · | · | · | · | A | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | A | · | T | · | · | · | · | T | · | A | T | T | A | · | · | T | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | T | C | A | · | · | C | · | T | · | C | C | · | C | C | T | · | C | A | · | · | T | · | C | T | T | A | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | G | · | · | · | · |
| Townsendi | Colombia | Lspini | G | · | · | · | · | G | · | A | · | · | · | A | T | C | A | C | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | C | C | · | · | G | · | · | T | T | G | A | C | · | · | · | T | A | G | · | · | G | T | · | · | · | A | C | T | G | C | · | · | A | T | A | · | T | · | · | · | T | · | · | · | · | · | A | · | T | · | T | · | · | · | · | · | · | · | G | A | · | · | T | A | · | T | · | · | G | · | T | · | A | T | T | A | · | · | T | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | T | · | A | · | · | C | · | T | · | C | C | · | C | C | T | · | C | A | · | · | T | · | C | T | T | A | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | G | · | G | G | · |
| Townsendi | Colombia | Lspini2 | G | · | · | · | · | · | · | A | · | · | · | A | T | C | A | C | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | C | C | · | · | G | · | · | T | T | G | A | C | · | · | · | T | A | G | · | · | G | T | · | · | · | A | C | T | G | C | · | · | A | T | A | · | T | · | · | · | T | · | · | · | · | · | A | · | T | · | T | · | · | · | · | · | · | · | · | A | · | · | T | A | · | T | · | · | G | · | T | · | A | T | T | A | · | · | T | · | · | · | A | · | · | · | · | · | · | T | · | A | · | · | C | · | T | · | C | C | · | C | C | T | · | C | A | · | · | T | · | C | T | T | A | · | · | · | C | · | · | T | · | · | · | G | · | G | G | · |
| Townsendi | Colombia | Ltorvida | G | T | · | · | · | · | · | A | · | · | · | A | A | C | A | · | · | · | · | · | · | · | · | T | C | · | · | · | C | · | · | · | · | · | T | T | A | · | · | · | · | · | T | A | G | · | · | G | C | · | · | G | A | · | T | A | C | · | · | A | T | A | · | A | · | · | · | T | · | G | · | · | · | A | · | · | · | T | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | A | · | T | · | · | · | · | · | · | C | T | T | A | · | · | T | T | · | · | A | · | · | · | · | · | · | T | C | G | · | · | T | · | T | · | T | C | T | C | T | T | · | · | A | · | · | T | G | · | T | T | A | · | · | · | · | · | · | T | · | C | · | A | T | · | · | · |
| Townsendi | Colombia | Ltorvida2 | G | T | · | · | · | · | · | A | · | · | · | A | A | C | A | · | · | · | · | · | · | · | · | T | C | · | · | · | C | · | · | · | · | · | T | T | A | · | · | · | · | · | T | A | G | · | · | G | C | · | · | G | A | · | T | A | C | · | · | A | T | A | · | A | · | · | · | T | · | · | · | · | · | A | · | · | · | T | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | A | · | T | · | · | · | · | · | · | C | T | T | A | · | · | T | T | · | · | A | · | · | · | · | · | · | T | C | G | · | · | T | · | T | · | T | C | T | C | T | T | · | · | A | · | · | T | G | · | T | T | A | · | · | · | · | · | · | T | · | C | · | A | T | · | · | · |
| Townsendi | Colombia | Lquasit | G | T | · | · | · | · | · | A | · | · | · | A | A | C | A | · | · | C | · | · | · | · | · | T | C | · | · | · | C | · | · | · | · | · | T | T | A | · | · | · | · | · | T | A | G | · | · | G | C | · | · | · | A | · | T | A | · | · | · | A | T | A | · | A | C | · | · | T | · | · | · | C | · | A | · | · | · | T | · | A | · | · | · | · | · | · | · | · | · | T | A | T | T | · | · | · | · | · | · | C | T | T | A | · | · | T | T | G | · | A | · | · | · | · | · | · | T | C | G | · | · | T | · | T | · | T | C | T | C | T | T | · | · | A | · | · | T | G | · | T | T | A | · | · | · | · | · | · | T | · | C | · | A | T | · | · | · |
| Townsendi | Colombia | Lquasit2 | G | T | · | · | · | · | · | A | · | · | · | A | A | C | G | · | · | · | · | · | · | · | · | T | C | · | · | · | C | · | · | · | · | · | T | T | A | · | · | · | · | · | T | A | G | · | C | G | C | · | · | G | A | · | T | A | C | · | · | A | T | A | · | A | · | · | · | T | · | · | · | · | · | A | · | · | · | T | · | A | · | · | · | · | · | G | · | · | · | T | A | · | T | · | · | · | · | · | · | C | T | T | A | · | · | T | T | G | · | A | · | · | · | · | · | · | T | C | G | · | · | T | · | T | · | T | C | T | C | T | T | · | · | A | · | · | T | G | · | T | T | A | · | · | · | · | · | · | T | · | C | · | A | T | · | · | · |
| Serrana | Peru | Lrobusta | · | · | A | A | T | T | · | C | · | · | · | A | A | · | A | · | · | · | · | · | C | · | A | T | · | C | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | · | C | C | T | · | T | A | G | T | · | · | C | · | · | · | A | · | · | A | C | · | · | T | · | A | T | A | T | A | · | T | A | · | · | · | · | · | · | · | C | T | · | · | · | · | A | · | · | G | · | T | A | T | A | · | T | · | C | T | · | · | · | · | T | · | G | T | A | T | T | G | · | A | · | T | · | · | · | · | T | · | A | · | · | T | · | T | · | T | · | · | C | T | T | · | C | A | A | A | T | · | · | T | · | A | · | · | · | · | · | · | · | T | · | · | · | · | · | · | · |
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