Skip to main content
. 2011 Jul 14;2011:160934. doi: 10.1155/2011/160934

Table 1.

Primers used in RT-PCR analysis.

Clone no. Primer name Sequence Anneal temperature (%)
SUC01 C418-F 5′-TGAAAGCCTCCACATCCT-3′ 55°C
C418-R 5′-CAACGAGCAGAAGACACG-3′ 55°C
SUC02 C165-F 5′-TATGGCCGTGTGTGTTATGG-3′ 60°C
C165-R 5′-AACGGCTCTTTTTGCAGCTA-3′ 60°C
SUC03 C220-F 5′-CAGGAACCTTCTGGCATCAT-3′ 60°C
C220-R 5′-ATGGGCATCAACAGACTTCC-3′ 60°C
SUC04 C203-F 5′-TGTTTTCACCGTTCAGTTCCT-3′ 59°C
C203-R 5′-ATCAGTCGCACCCTGAAGAT-3′ 59°C
SUC05 C149-F 5′-CGATTACGGATTACTAGGTATTAGGA-3′ 58°C
C149-R 5′-CGATTCATTTCAATATGAGGACA-3′ 58°C
SUC06 C312-F 5′-TGGCTTAGGGCTGATACTGG-3′ 58°C
C312-R 5′-TCAAACGCTGACCCGAGA-3′ 58°C
SUC07 C362-F 5′-TGGGATGACGATACACCG-3′ 56°C
C362-R 5′-AGGCTCCTTCAAATGTAGATAG-3′ 56°C
SUC08 C217-F 5′-TCCTTTGGTTCCATTTGCTC-3′ 58°C
C217-R 5′-CGTGCAAATTAGGACTGTCG-3′ 58°C
SUC09 C308-F 5′-TGTCTCCAAACCACGAAC-3′ 55°C
C308-R 5′-TACAGAAGCCACAAGGGA-3′ 55°C
SUC10 C243-F 5′-TGGTTATTGGGCAGTCAA-3′ 55°C
C243-R 5′-ACGGCAGTAAGCAGAGGT-3′ 55°C
SUC11 C266-F 5′-AAAGCAACCCGAGATTTTCC-3′ 60°C
C266-R 5′-TAGGCGGAGAGGATGTAGGA-3′ 60°C
SUC12 C363-F 5′-AGTTTGCACCCGGTAGTGAC-3′ 59°C
C363-R 5′-ATGATGCCACCCTACCACTC-3′ 59°C
SUC13 C141-F 5′-GACCCAAGGGTCAATGTCTG-3′ 57°C
C141-R 5′-GCCCATCATACAATCCCTTC-3′ 57°C
SUC14 C275-F 5′-ACCAGTGCCACTTCATCCTC-3′ 60°C
C275-R 5′-TGCTGGCTATTGTTGGACAG-3′ 60°C
SUC15 C217-F 5′-TATGGCCATGGTGTTTATGG-3′ 56°C
C217-R 5′-AACGGTCCTTTTTGCACCTA-3′ 56°C
SUC16 C214-F 5′-GGCCATTGAGCACCTAACAT-3′ 56°C
C214-R 5′-CATGGGTCAGCATCATCAAC-3′ 56°C
SUC17 C404-F 5′-TAGTGGTGCGACCACACAAT-3′ 60°C
C404-R 5′-CGAACAGGGCCACTATGTCT-3′ 60°C
SUC18 C190-F 5′-CCGTGACCCTTCAATGTTTT-3′ 58°C
C190-R 5′-CCAACTTCCAAAGGGCTACA-3′ 58°C
SUC19 C211-F 5′-TTAGACCTTGCCCCCTTTTT-3′ 57°C
C211-R 5′-CCTGAGTAACATGATGGGTCCT-3′ 57°C
SUC20 C288-F 5′-GCATAGCCTTTCAGGTGG-3′ 56°C
C288-R 5′-TCGGGTGAACGATGAGGT-3′ 56°C
SUC21 C274-F 5′-AAACACTGGCTTAGGGCTGA-3′ 58°C
C274-R 5′-CAGCTCAGATCAAACGCTGA-3′ 58°C
SUC22 C256-F 5′-CTGATTCTTACTATTGGTGGTG-3′ 55°C
C256-R 5′-TGGATGCTCTGCTGCTAT-3′ 55°C
SUC23 C363-F 5′-AGTTTGCACCCGGTAGTGAC-3′ 58°C
C363-R 5′-ATGATGCCACCCTACCACTC-3′ 58°C
SUC24 C244-F 5′-GACCTCTCCACCCCTAGACC-3′ 57°C
C244-R 5′-GGAGAAGCATGGTTCCAAAA-3′ 57°C
SUC25 C169-F 5′-GTTGGTGATCCTGAGGGAAC-3′ 56°C
C169-R 5′-AGTCGAGTGCAGCCCTACAT-3′ 56°C
SUC26 C436-F 5′-TCCAAAGGCATGAAGGAAAC-3′ 58°C
C436-R 5′-CGTCGTCATCTACCTGCTCA-3′ 58°C
SUC27 C436-F 5′-TCCAAAGGCATGAAGGAAAC-3′ 57°C
C436-R 5′-CGTCGTCTACCTGCTCATCA-3′ 57°C
SUC28 C315-F 5′-CTCCACCAGCTGATGTTCCT-3′ 60°C
C315-R 5′-ACCACAACATCACGGAATGA-3′ 60°C
SUC29 C364-F 5′-AGTTTGCACCCGGTAGTGAC-3′ 60°C
C364-R 5′-GACGATGAGCCTCGTTTAGG-3′ 60°C
SUC30 C217-F 5′-TATCCGGGGTGTTGTTATGG-3′ 58°C
C217-R 5′-AACGTCGCTTTTCGTAGCTA-3′ 58°C
SUC31 C427-F 5′-CCCGTCCTAGAGAGGAGGTC-3′ 58°C
C427-R 5′-AGGTCTTTCAGGCAACATCG-3′ 58°C
SUC32 C255-F 5′-TAAAGGCGACACCTCTAGGC-3′ 57°C
C255-R 5′-AACTTCAGGCTTTGGTGCTC-3′ 57°C
SUC33 C291-F 5′-CACACAATGACCATGCAACA-3′ 58°C
C291-R 5′-AATGGCGAAGCAATGTTTTT-3′ 58°C
SUC34 C312-F 5′-GGGTCACCGTCAGCCTACT-3′ 56°C
C312-R 5′-GGAGCCAGCACTCCATTT-3′ 56°C
SUC35 C312-F 5′-TCCTTATGCCAGAGGGTCAC-3′ 59°C
C312-R 5′-GGAGCCAGCACTCCATTTTA-3′ 59°C
SUC36 C270-F 5′-AAGGATCTTTGCAAGCATGG-3′ 57°C
C270-R 5′-AGGTCTTTCAGGCAACATCG-3′ 57°C
SUC37 C206-F 5′-TCCTATGATGACTGCCAAGC-3′ 58°C
C206-R 5′-CAAACTTCCATGTTTCCTCCA-3′ 58°C
SUC38 C217-F 5′-TATGGCCTGTGTGGTTATGG-3′ 60°C
C217-R 5′-AACGTCTCGTTTTGCAGCTA-3′ 60°C
SUC39 C121-F 5′-TGAGGGAACCTGTTCGAG-3′ 55°C
C121-R 5′-GAGTGCAGCCCTACATTG-3′ 55°C
SUC40 C142-F 5′-TTAGGAGATGTTGCTCCAAGC-3′ 57°C
C142-R 5′-GCCTCTTTCTTTCTTCCATGC-3′ 57°C
25S rRNA 25S rRNA-F 5′-GCAGCCAAGCGTTCATAG-3′ 56°C
25S rRNA-R 5′-CGGCACGGTCATCAGTAG-3′ 56°C