Table 2.
Description of the mtDNA Genomes Reported in this Investigation.
| ND1 (bases/aa) | ND2 (bases/aa) | COX1 (bases/aa) | COX2 (bases/aa) | ATP8 (bases/aa) | ATP6 (bases/aa) | COX3 (bases/aa) | ND3 (bases/aa) | ND4L (bases/aa) | ND4 (bases/aa) | ND5 (bases/aa) | Cytb (bases/aa) | ND6 (bases/aa) | ||
| Species | mtDNA Length (bp) | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon | Start/Stop Codon |
| Gallicolumba luzonica | 15,192 (partial) | 963/321 ATG/AGA | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG/AGG | 678/226 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATA/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1815/605 ATG/AGA | 1140/380 ATG/TA- | incomplete |
| Geopelia striata | 15,859 (partial) | 963/321 ATG/AGA | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATA/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1374/458 ATG/T-- | 1815/605 ATG/AGA | 1140/380 ATG/TAA | 519/173 ATG/TAG |
| Chalcophaps indica | 15,363 (partial) | 963/321 ATG/AGA | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATA/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1812/604 GTG/AGA | 1140/380 ATG/TAA | incomplete |
| Turtur tympanistria | 15,557 (partial) | 963/321 ATG/AGA | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATT/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1815/605 GTG/AGG | 1140/380 ATG/TAA | 519/173 ATG/TAG |
| Geotrygon violacea | 16,864 | 963/321 ATG/AGA | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATC/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1815/605 ATG/AGA | 1140/380 ATG/TAA | 519/173 ATG/TAG |
| Zenaida auriculata | 16,781 | 963/321 ATG/AGA | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATT/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1815/605 ATG/AGA | 1140/380 ATG/TAA | 516/172 ATG/TAG |
| Leptotila verreauxi | 17,176 | 963/321 ATG/AGA | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATC/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1815/605 ATG/AGA | 1140/380 ATG/TAA | 519/173 ATG/TAG |
| Nyctibius griseus | 14,769 (partial) | 975/325 GTG/A-- | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATC/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1815/605 ATG/TAA | 1140/380 ATG/TAA | incomplete |
| Geococcyx californianus | 17,651 | 978/326 ATG/TAA | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 162/54 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATA/T-- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1815/605 ATG/AGA | 1140/380 ATG/TAA | 519/173 ATG/TAG |
| Crotophaga ani | 15,774 (partial) | 975/325 ATG/AGA | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATC/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1812/604 ATG/AGA | 1140/380 ATG/TAA | 519/173 ATG/AG- |
| Forpus modestus | 14,849 (partial) | 978/326 ATG/A-- | 1038/346 ATG/TA- | 1545/515 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATC/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1392/464 ATG/T-- | 1815/605 GTG/TAA | 1137/379 ATG/TAA | incomplete |
| Brotogeriscyanoptera | 17,369 | 978/326 ATG/A-- | 1038/346 ATG/TA- | 1545/515 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATA/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1392/464 ATG/T-- | 1812/604 GTG/TAA | 1134/378 ATG/TAA | 501/167 ATG/AG- |
| Aratinga pertinax | 16,980 | 978/326 ATG/A-- | 1038/346 ATG/TA- | 1545/515 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATA/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1392/464 ATG/T-- | 1812/604 GTG/TAA | 1137/379 ATG/TAA | 510/170 ATG/AG- |
| Nymphicus hollandicus | 16,781 | 978/326 ATG/A-- | 1038/346 ATG/TA- | 1545/515 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATA/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1392/464 ATG/T-- | 1812/604 ATG/TAA | 1137/379 ATG/TAA | 513/171 ATG/AG- |
| Bucorvus leadbeateri | 17,061 | 975/325 ATG/A--- | 1038/346 ATG/T-- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 ATG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATT/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1812/604 ATG/AGA | 1140/380 ATG/TAA | 519/173 ATG/AG- |
| Bycanistes brevis | 17,591 | 975/325 ATG/A-- | 1038/346 ATG/TA- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 GTG/TAA | 165/55 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATC/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1812/604 GTG/AGA | 1140/380 ATG/TAA | 519/173 ATG/AG- |
| Aceros corrugatus | 16,150 (partial) | 975/325 ATG/A-- | 1038/346 ATG/TA- | 1548/516 GTG/AGG | 681/227 GTG/TAA | 162/54 ATG/TA- | 681/227 ATG/TA- | 783/261 ATG/T-- | 348/116 ATC/TA- | 294/98 ATG/TAA | 1377/459 ATG/T-- | 1809/603 ATG/AGA | 1140/380 ATG/TAG | 519/173 ATG/TA- |
NOTE.—Start and stop codons are indicated for each sequence.