Table 3. Novel candidate T3SS effector proteins.
Novel T3SS effector | S. enterica subspecies and serovars | ||||||||
Genomic Location | Gene name | Protein family | S. bongori 12419 | S. Typhi CT18 | S. Typhimurium LT2 | S. Enteritidis P125109 | S. Gallinarum 287/91 | S. Cholerasuis SC-B67 | S. arizonae CDC346-86 |
BB | sboH | sopA-nleH1 chimera | SBG_1891 | − | − | − | − | − | − |
øSB100 | sboA | sopA | SBG_0925 | − | − | − | − | −− | − |
ROD | sboB | sopA | SBG_0789 | − | − | − | − | − | − |
ROD | sboC | espJ | SBG_2380 | − | − | − | − | SARI_00261 | |
ROD | sboD | nleI/G | SBG_2043 | STY1076 | − | − | − | − | − |
Degenerate ø | sboE | nleI/G | SBG_0673Ψ | − | − | − | − | − | − |
øSB100 | sboF | nleI/G | SBG_0924 | - | − | − | − | − | − |
øSB101 | sboG | nleI/G | SBG_0932 | − | − | − | − | − | − |
ROD | sboI | LRP | SBG_1086 | − | − | − | − | − | − |
ROD | sboJ | LRP | SBG_1076 | − | − | − | − | − | − |
ROD | sboK | LRP | SBG_0970 | − | − | − | − | − | − |
ROD | sboL | LRP | SBG_0969 | − | − | − | − | − | − |
LRP, leucine rich repeat protein, BB chromosomal backbone; ROD region of difference/genomic island; προπηαγε. Ψ, pseudogene.