Table 2.
Protein name | Form | Chl | Chloroplast targeting signal |
---|---|---|---|
AcoTrz1 | AcoTrzS1 | - | |
AcoTrz2 | AcoTrzS2 | C | MKISLGISTSPILLPFSKPTLKIPHNRVCIP (31) |
AlyTrz1 | AlyTrzS1 | - | |
AlyTrz2 | AlyTrzS2 | C | MQLSSFPISPSKIFPFTKYHAPPVIIHQLAAQIQSHRSNFVSPVKVSGYFSSISRAIEEEEEYRKAR (67) |
AthTrz1 | AthTrzS1 | - | |
AthTrz2 | AthTrzS2 | C | MQLSSSFPISPPKIFPSTKHHKPPVITHQLAAQIQSNRRHFVSPVKVSGYFSSISRAIEEEEEYRKAR (68) |
BdiTrz1 | BdiTrzS1 | - | |
BdiTrz2 | BdiTrzS2 | C | MATISLFSLPPLRLTRGLLSPSSGPASRFQTL (32) |
CpaTrz1 | CpaTrzS1 | - | |
CpaTrz2 | CpaTrzS2 | C | MLTSVPILPSKLQSVFPFGHHHYHSISHKPTPIHQFSFLV (40) |
CclTrz1 | CclTrzS1 | - | |
CclTrz2 | CclTrzS2 | C | MQLSLPTSPSKLPTIFPFHPSSIPKTPQSPHHLSLQSHVGPLNALKSAGFLSSISRAIDEEEEYRKAR (68) |
CsiTrz1 | CsiTrz S1 | - | |
CsiTrz2 | CsiTrz S2 | C | MQLSLPTSPSKLPTIFPFHPSSIPKTPQSPHHLSLQSHVGPLNALKSAGFLSSISRAIDEEEEYRKAR (68) |
CsaTrz1 | CsaTrzS1 | - | |
CsaTrz2 | CsaTrzS2 | C | MQISIPISPLRPPQVFPFHQPLLHTPKPPGVALQSHLNPVNSFRDSGLLSTIGVE (55) |
EgrTrz1 | EgrTrzS1 | - | |
EgrTrz2 | EgrTrzS2 | C | MRISIPISPSKSPQIFPFHHHHRRRHQIPDLRRRPPALSLPASAVNPLKSSGYLSTIHR (59) |
GmaTrz1 | GmaTrzS1 | - | |
GmaTrz2 | GmaTrzS2 | C | MQISLSDLAFKTPQLFPIHHPIFPPKPPLNHQVST (35) |
MesTrz1 | MesTrzS1 | - | |
MesTrz2 | MesTrzS2 | C | MQTSFPVSPSKIPSIFPFNHPILHNPTAPTNHHQLPLQTYLKRPINSTSLKSSGFLSAIGRAIEEEEEYKKAR (73) |
MtrTrz1 | MtrTrzS1 | - | |
MtrTrz2 | MtrTrzS2 | C | MQIPLTNPTFKPPQIFPFHHTIPSPKQQLSFPT (33) |
MguTrz1 | MguTrzS1 | - | |
MguTrz2 | MguTrzS2 | C | MITLNPTTSNLLNLHPFHPTPATHKHHLPPQTRRSVIACVSDAVV (45) |
OsaTrz1 | OsaTrzS1 | C | MANSGKSSPAATSTTAPPPGRPKAKAPPLTVEGYPVEGISIGGQETCVIFPT (52) |
OsaTrz2 | OsaTrzS2 | C | MAATSLLSLPSLRLTHRLLVPASSSAPASRSQFQTL (36) |
PtrTrz1 | PtrTrzS1 | - | |
PtrTrz2 | PtrTrzS2 | C | MQISIPL (7) |
PpeTrz1 | PpeTrzS1 | - | |
PpeTrz2 | PpeTrzS2 | C | MQIFLTISPCKAPLILPFHPPISKTPKTQRTSLKTLSKPYRLARSQVLRKGV (52) |
RcoTrz1 | RcoTrzS1 | - | |
RcoTrz2 | RcoTrzS2 | C | MQTSLPISHSKFPSIFPFNHPISHKPTTTR (30) |
SitTrz1 | SitTrzS1 | - | |
SitTrz2 | SitTrzS2 | C | MATASLFSPPSLRLLSRTTARLSRFQTLAARKPP (34) |
SitTrz3 | SitTrzS3 | - | |
SitTrz4 | SitTrzS4 | - | |
SbiTrz1 | SbiTrzS1 | - | |
SbiTrz2 | SbiTrzS2 | C | MATASLFSLPSLRALSRTSARCSRFQTLAARKPVESSSSTATS (43) |
SbiTrz3 | SbiTrzS3 | - | |
VviTrz1 | VviTrzS1 | - | |
VviTrz2 | VviTrzS2 | C | MQISLPFSTSKVPYLSPLPNPTPQPPLTIPKPHPKSYIT (39) |
ZmaTrz1 | ZmaTrzS1 | - | |
ZmaTrz2 | ZmaTrzS2 | C | MVTASLFSLPSLRVLSRTSAHGPRFQILAARKPVESSTATSGSRRGGSKGAGLLSVLDR (59) |
Identification of the putative chloroplast targeting signals was made by using ChloroP http://www.cbs.dtu.dk/services/ChloroP/. Chl stands for the chloroplast. C indicates chloroplast localization. "-", the localization could not be predicted. The numbers refer to amino acid positions starting from the N-terminus.