Table 1. Percentages of loss, disomy, gain by type of tumor, probe analyzed and test applied.

LG NI
Probe	Test	% loss	(95% CI)	% diso	(95% CI)	% gain	(95% CI)	p-value
CEP 3	FIN	13,2	(6,7 ; 24,3)	57,9	(32,2 ; 79,9)	28,9	(23,5 ; 35,0)	0,520
	FFPE	10,0	(4,2 ; 22,1)	55,0	(35,2 ; 73,3)	35,0	(30,5 ; 39,7)
CEP 7	FIN	28,0	(14,6 ; 47,0)	57,8	(35,6 ; 77,2)	14,2	(13,1 ; 15,4)	0,134
	FFPE	10,4	(5,0 ; 20,6)	70,2	(57,2 ; 80,6)	19,3	(17,6 ; 21,1)
CEP 17	FIN	14,4	(9,2 ; 21,7)	71,3	(56,7 ; 82,5)	14,4	(12,7 ; 16,1)	0,133
	FFPE	9,1	(5,1 ; 15,7)	68,9	(50,9 ; 82,5)	22,0	(18,9 ; 25,5)
LSI 9p21	FIN	84,9	(53,6 ; 96,5)	14,5	(3,2 ; 46,6)	0,6	(0,6 ; 0,6)	0,323
	FFPE	73,2	(55,1 ; 85,9)	24,0	(10,9 ; 45,0)	2,8	(2,7 ; 2,8)

p-values refer to the comparison between the two type of analysis obtained by a multinomial model with 95% confidence interval.