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. 2011 Sep;85(17):8929–8939. doi: 10.1128/JVI.00336-11

Table 1.

Primers used in PCR

Primer Sequences
PmiBH-1f 5′-CACCTTAGGAAGCACCACGTCC-3′
PmiBH-2f 5′-CACCGGACGGCTCCTTATTAAC-3′
PmiBH-1r 5′-AAACCTACTACCCCATTG-3′
PmiBH-2r 5′-TTAGTGTCTTCCTCTGGA-3′
PmiBH-3r 5′-TCAGGTTAATAAGGAGC-3′
BHRF1-1 5′-CACCATGGCCTATTCAACAAGG-3′
Loop1 5′-CAGCCCCGGAGTTGCCTTTCATCACTAACCC-3′
Loop2 5′-GGGTTAGTGATGAAAGGCAACTCCGGGGCTG-3′
PmiBHmu1 5′-CCTGTTTCATCACTAACCTTAATTAAGAAGAGGTTGACAAGAAG-3′
PmiBHmu2 5′-GATAGCTGATACCCAATGTCTCGAGAATTGGCAGAAATTGAAAGTG-3′
PmiBHmu3 5′-CACGTAATTTGCAAGCGGGATATCTGTTTCTTCGTTAAAATAACAC-3′
NheR1 5′-CTTGCTGCTAGCTCCAACA-3′
Not F1 5′-CGCTGCGGCCGCTATTAACCTGATCAGCC-3′
Not F2 5′-CGCTGCGGCCGCGGTCAAGGTTTCGTCTG-3′
Not F3 5′-CGCTGCGGCCGCCGAGATGTCACGTTGTG-3′
Not F4 5′-CGCTGCGGCCGCTCCCACCCTCAATTTTC-3′
Not F5 5′-CGCTGCGGCCGCAGATCTTGTAGAGCAAGA-3′
pmiR1 5′-CTTAACCTGATCAGCCCCGGAGTAAA-3′
pmiR2 5′-CGCTATCTTTTGCGGCAGAAATTGAAAGTG-3′
pmiR3 5′-GCTAACGGGAAGTGTGTAAGCACACAA-3′
pmiR16 5′-CGCTAGCAGCACGTAAATATTGGCGAA-3′
pactbF 5′-CAGATCATGTTTGAGACCTT-3′
pactbR 5′-GGTGACCCCGTCACCGGAGT-3′
pF1F 5′-GTCCCGGGGACGGAAGGGGAC-3′
pF1R 5′-CTTATTCTTGCTCATATTTCC-3′
pF2F 5′-GTCTCCGGGTGGGCAGGCAG-3′
pF2R 5′-GACACAGACCTGAAACACAAC-3′
pF3F 5′-GATATTTCACCGTGGAGACCCA-3′
pF3R 5′-TGACAGGTCCACAACATAGTAA-3′
pF4F 5′-GGACAAGATACTAAAGAAATAA-3′
pF4R 5′-TCCCCCCGAGTCTGGGCTGCAG-3′
pF5F 5′-GGAAATATGAGCAAGAATAAG-3′
pF5R 5′-AGACGAAACCTTGACCCTTC-3′
pF6F 5′-ACAAGAATAACATGCCAATGA-3′
pF6R 5′-TATCCCACCTAGGACACCCAA-3′
pF7F 5′-AAGGGCAGGGGCTGTTGGGTG-3′
pF7R 5′-CCGGAGACCTGCATCTGCACA-3′