Table 3. Peroxisomal proteins from different organisms representing the major eukaryotic groups and their predicted targeting signals.

eukaroytic group	organism	Pex7	3-ketoacyl-CoA thiolase	acyl-CoA oxidase	citrate synthase	malate dehydrogenase
Chromalveolata	Phaeodactylum tricornutum	—	PTS1	PTS1	x	x
	Thalassiosira pseudonana	—	PTS1	PTS1	x	PTS1
	Fragilariopsis cylindrus	—	PTS1	PTS1	x	x
	Ectocarpus siliculosus	yes	PTS2	x	x	x
	Phytophthora infestans T30-4	yes	PTS2	PTS2	x	PTS1
	Perkinsus marinus	yes	PTS2	PTS1	x	x
	Tetrahymena thermophila	yes	PTS2	PTS2	PTS1, PTS2	PTS2
Plantae	Cyanidioschyzon merolae	—	PTS1a	PTS1	PTS1	x
	Chlamydomonas reinhardtii	yes	PTS2	PTS1	PTS2	PTS2
	Volvox carteri	yes	PTS2	PTS2	PTS2	PTS2
	Physcomitrella patens	yes	PTS2	PTS1	PTS1, PTS2	PTS2
	Arabidopsis thaliana	yes	PTS2	PTS1, PTS2	PTS1, PTS2	PTS2
Excavata	Naegleria gruberi	yes	PTS1	PTS2	x	x
Unikonta	Trichoplax adhaerens	yes	PTS2	PTS1	x	x
	Dictyostelium discoideum	yes	PTS2	PTS1, PTS2	PTS2	PTS2
	Saccharomyces cerevisiae	yes	PTS2	b	PTS1	PTS1
	Ustilago maydis	yes	PTS2	PTS1	x	x
	Caenorhabditis elegans	—	PTS1	PTS1	PTS1	x
	Danio rerio	yes	PTS2	PTS1	x	x
	Mus musculus	yes	PTS2	PTS1	x	x
	Rattus norvegicus	yes	PTS2	PTS1	x	x

^apossible unkown derivat AAL of the conventional PTS1 consensus sequence.

^bthe peroxisomal acyl-CoA oxidase of S. cerevisiae lacks both PTS1 and PTS2 targeting signal [60].

It should be noted that currently no genome data of a rhizarian organism is available. PTS1, peroxisomal targeting signal 1; PTS2, peroxisomal targeting signal 2; x, no peroxisomal orthologs identified; —, no orthologs identified.