Table 2.

Top Association Results in European-American Samples with Cases Defined as ETDRS Grade ≥14 for Variants within Genes Previously Associated with DR, DN, or T2D

SNP	Chr	Gene	Position	Minor Allele	ARIC				CHS				MESA				CMH Combined Analysis						P Correction
					MAF		OR	P	MAF		OR	P	MAF		OR	P	MAF		OR	L95	U95	P	Bonferroni	Permutation
					Cases	Controls			Cases	Controls			Cases	Controls			Cases	Controls
rs6128	1	SELP	167829528	T	0.08	0.16	0.48	0.0007	0.06	0.18	0.30	0.02	0.08	0.20	0.36	0.02	0.08	0.17	0.43	0.31	0.62	3.1 × 10−6	0.0001	0.0001
rs6133	1	SELP	167831970	A	0.05	0.12	0.39	0.0003	0.03	0.13	0.22	0.02	0.07	0.13	0.50	0.16	0.05	0.12	0.38	0.25	0.59	1.1 × 10−5	0.0004	0.0001
rs3917779	1	SELP	167837472	A	0.05	0.12	0.40	0.0004	0.03	0.12	0.23	0.03	0.07	0.13	0.50	0.16	0.05	0.12	0.39	0.26	0.60	1.6 × 10−5	0.0006	0.0001
rs12262390	10	HHEX	94436103	C	0.12	0.09	1.48	0.05	0.15	0.10	1.61	0.22	0.18	0.09	2.27	0.03	0.14	0.09	1.61	1.18	2.20	0.002	0.10	0.004
rs9356754	6	CDKAL1	20916721	G	0.51	0.43	1.37	0.01	0.53	0.44	1.43	0.18	0.40	0.38	1.09	0.74	0.49	0.42	1.32	1.08	1.63	0.007	0.29	0.008
rs9465904	6	CDKAL1	20929641	C	0.37	0.30	1.38	0.01	0.42	0.33	1.49	0.15	0.28	0.26	1.08	0.79	0.36	0.30	1.34	1.08	1.65	0.008	0.33	0.01
rs11466493	3	TGFBR2	30661786	G	0.01	0.04	0.14	0.002	0.06	0.05	1.23	0.72	0.04	0.07	0.59	0.41	0.02	0.05	0.41	0.21	0.80	0.009	0.35	0.01
rs17025862	3	TGFBR2	30660132	G	0.01	0.04	0.14	0.002	0.06	0.05	1.23	0.72	0.04	0.07	0.59	0.41	0.02	0.05	0.41	0.21	0.80	0.009	0.35	0.01
rs7747989	6	CDKAL1	20921354	C	0.37	0.30	1.35	0.02	0.44	0.33	1.60	0.09	0.28	0.26	1.08	0.79	0.36	0.30	1.33	1.07	1.65	0.009	0.36	0.01
rs2328572	6	CDKAL1	21323815	A	0.003	0.02	0.15	0.03	0	0.03	NA	NA	0.01	0.03	0.48	0.48	0.005	0.02	0.19	0.05	0.69	0.01	0.44	0.01
rs10214694	6	CDKAL1	21321533	T	0.003	0.02	0.15	0.03	0	0.03	NA	NA	0.01	0.03	0.48	0.48	0.005	0.02	0.19	0.05	0.69	0.01	0.45	0.01
rs12190631	6	CDKAL1	21020651	G	0.05	0.03	1.38	0.30	0.12	0.02	6.17	0.0001	0.01	0.01	1.29	0.83	0.05	0.03	1.85	1.14	3.01	0.01	0.51	0.02
rs2275729	10	HHEX	94442410	G	0.15	0.12	1.32	0.13	0.15	0.12	1.29	0.51	0.21	0.10	2.26	0.02	0.16	0.12	1.44	1.08	1.92	0.01	0.52	0.02
rs1511024	4	FABP2	120459629	T	0.05	0.03	1.74	0.07	0.05	0.02	3.00	0.12	0.06	0.03	1.76	0.35	0.05	0.03	1.86	1.13	3.06	0.01	0.55	0.01
rs9350294	6	CDKAL1	20978072	T	0.38	0.32	1.26	0.07	0.44	0.32	1.65	0.07	0.33	0.29	1.24	0.45	0.38	0.32	1.31	1.05	1.61	0.01	0.55	0.01

The minor allele is the effect allele for the ORs. Chr, chromosome; L95, lower 95% CI boundary; U95, upper 95% CI boundary; NA, not available.