Table 1.
E. coli strains used to determine method specificitya
| Strain | VTEC PCR module specificity |
|||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| stx1 | stx2 | eae | O103 | O111 | O145 | O157 | O26 | |
| C210-03 (O157,stx1b,stx2c, eae) | + | + | + | − | − | − | + | − |
| ED 620 (O157, eae) | − | − | + | − | − | − | + | − |
| ED 621 (O157, eae) | − | − | + | − | − | − | + | − |
| C1178-04 (O145,stx1a,eae) | + | − | + | − | − | + | − | − |
| ED 645 (O145, stx2a, eae) | − | + | + | − | − | + | − | − |
| ED 657 (O145, stx2a, eae) | − | + | + | − | − | + | − | − |
| C125-06 (O103,stx2,eae) | − | + | + | + | − | − | − | − |
| ED 287 (O103, stx1a, eae) | + | − | + | + | − | − | − | − |
| ED 259 (O103, stx1a, eae) | + | − | + | + | − | − | − | − |
| MM13-02 (O111,eae) | − | − | + | − | + | − | − | − |
| ED 476 (O111, stx1a, stx2a, eae) | + | + | + | − | + | − | − | − |
| C1188-02 (O26,stx1a,stx2a,eae) | + | + | + | − | − | − | − | + |
| ED 643 (O26, stx1a, eae) | + | − | + | − | − | − | − | + |
| ED 654 (O26, stx2a, eae) | − | + | + | − | − | − | − | + |
a
Results derived from CT means ± SD from three repetitions. Reference strains are shown in boldface. The presence of the target gene(s) and serogroup for each strain is indicated in parentheses.