Table 2. Neutralizing profile of selected patient plasma against subtype A, subtype C and CRF02_AG isolates in the 24/1/14 extended incubation PBMC assay.
Subtype A | Subtype C | Subtype CRF02 | |||||||||||||
Patient code | Subtype | VI 191 | 92UG37 | VI 820 | VI 1031 | VI 829 | VI 882 | VI 1144 | VI 1358 | VI 1090 | VI 2680 | CI 20 | CA 18 | VI 1380 | VI 2727 |
HGL-plasma | A | 87,4 | E | 97,2 | 95,9 | E | 84,9 | 62,0 | 73,7 | 91,1 | 78,1 | 89,5 | 94,9 | 67,6 | 97,0 |
HGD-plasma | B | 84,9 | 80,9 | 94,8 | 97,7 | 55,3 | 96,9 | 99,7 | 24,1 | 91,1 | 86,2 | 66,1 | 94,2 | 10,9 | 99,9 |
HQ-plasma | CRF02 | 98,5 | 97,7 | 96,6 | 90,0 | 66,1 | 99,3 | 8,8 | 0,0 | 10,9 | E | 99,8 | 97,8 | 98,2 | 99,4 |
HGN-plasma | CRF02 | 80,5 | 96,1 | 87,4 | 55,3 | 91,1 | 63,7 | 74,3 | 93,7 | 91,1 | 73,7 | 88,3 | 97,2 | 96,1 | E |
HVDA-plasma | C | 24,1 | 70,5 | 86,8 | 66,1 | 0,0 | 99,9 | 91,1 | 86,2 | 89,3 | 66,1 | 41,1 | 90,5 | 69,1 | 0,0 |
HK-plasma | CRF02 | 97,7 | 62,0 | 65,3 | 99,8 | 99,0 | 32,4 | 95,4 | 96,0 | 98,8 | 88,3 | 97,7 | 59,3 | 96,4 | 69,8 |
HMB-plasma | A/C | 98,8 | 99,9 | 52,1 | 98,2 | 99,9 | 99,9 | E | 80,0 | 54,3 | 80,0 | 91,1 | 94,8 | 55,3 | 78,1 |
HJ-plasma | C | 96,0 | 98,2 | 60,2 | 97,2 | 85.9 | 99.4 | 99,0 | 94.8 | 94,8 | 0,0 | 93,1 | 97,0 | 0,0 | 84,5 |
HGR-plasma | B | 98,7 | 97,8 | 96,0 | 98,7 | 96,0 | 91,1 | 96,9 | 66,1 | 88,8 | 80,0 | 71,2 | 94,8 | 97,0 | 78,1 |
HMQ-plasma | A/CRF11 | 73,7 | E | 69,1 | 94,0 | E | 92,2 | 83,4 | 96,9 | 99,6 | 93,8 | 96,8 | 97,8 | 75,5 | 98,6 |
HU-plasma | B/CRF03/CRF13 | 95,1 | 90,0 | 95,9 | 98,9 | 80,9 | 99,2 | 98,8 | E | 96,4 | 59,3 | 94,8 | 92,8 | 81,4 | 96,9 |
HP/HM/HGM-plasma | CRF02 | 88,3 | 98,5 | 47,5 | 97,9 | 80,0 | 98,2 | 99,0 | 65,3 | 99,8 | 88,8 | 90,2 | 99,4 | 99,6 | 91,1 |
HGE-plasma | A/CRF02 | 99,4 | 97,7 | 98,4 | 99,8 | 96,0 | 98,1 | 66,1 | 97,9 | 99,7 | 93,2 | 99,1 | 99,0 | 80,0 | 99,0 |
HY-plasma | A/CRF02 | 66,1 | 99,5 | 99,2 | 99,6 | 80,0 | 98,6 | 99,5 | 98,9 | 94,4 | 99,0 | 84,5 | 88,3 | 98,2 | 93,1 |
HMV-plasma | C | 99,4 | 98,2 | 99,5 | 94,1 | 91,1 | 96,9 | 98,8 | 99,5 | 99,8 | 91,1 | 99,6 | 99,3 | 98,9 | 98,2 |
HL-plasma | CRF02 | 80,0 | 66,9 | 53,2 | 80,0 | 84,5 | 98,2 | 22,4 | 53,2 | 80,0 | 63,7 | 79,1 | 99,2 | 94,2 | 73,7 |
HZ-plasma | A/CRF02 | 42,5 | 94,8 | 69,1 | 93,5 | 94,4 | 55,3 | E | E | 62,0 | E | E | 80,0 | 85,9 | E |
HGP-plasma | A/CRF02/CRF13/CRF09 | 41,1 | 87,4 | 94,2 | 42,5 | 55,3 | 76,6 | 73,7 | 90,9 | 99,2 | 91,9 | 55,3 | 30,8 | 91,9 | 91,7 |
HR-plasma | CRF02 | 73,7 | 80,0 | 71,8 | 79,6 | E | 98,6 | 55,3 | E | 99,5 | E | 98,2 | 80,0 | E | 96,9 |
HMA-plasma | A | 0,0 | E | E | 99,4 | 0,0 | 88,3 | 66,1 | 88,3 | 96,9 | 86,2 | 74,3 | 0,0 | E | 99,6 |
% Neutralization obtained with 1∶20 plasma dilution, ≥80% reduction in virus titer is highlighted in italics, E: enhancement of infection, subtype specific neutralization in bold: ≥80% neutralization with at least 75% of isolates within a subtype.