Table 1.

Coverage depth of Brassica contigs anchored onto Arabidopsis genome sequence.

	Before removing ancient duplication		After removing ancient duplication
Coverage depth	Covered length (Kb)	Fraction	Covered length (Kb)	Fraction
B. oleracea
0	15742	0.132	17125	0.144
1	20164	0.169	22832	0.192
2	28996	0.244	31783	0.267
3	28731	0.241	28741	0.242
4	15972	0.134	12860	0.108
5	6275	0.053	3943	0.033
6	1916	0.016	940	0.008
7	683	0.006	400	0.003
8	150	0.001	20	0.000
9	34	0.000	27	0.000
10	130	0.001	130	0.001
11	167	0.001	168	0.001
12	12	0.000	7	0.000
> 13	28	0.000	24	0.000
B. rapa
0	8614	0.072	10857	0.091
1	13673	0.115	19177	0.161
2	18150	0.153	22888	0.192
3	22567	0.190	26523	0.223
4	21306	0.179	19988	0.168
5	16264	0.137	10861	0.091
6	9219	0.077	4029	0.034
7	4379	0.037	1723	0.014
8	1944	0.016	612	0.005
9	634	0.005	202	0.002
10	242	0.002	213	0.002
11	172	0.001	97	0.001
12	107	0.001	106	0.001
13	1729	0.015	1724	0.014