Table 4. Allelic variation in 30 Physalis peruviana SSR loci.

Polymorphic loci	Forward primer (5′-3′)	Reverse primer (5′-3′)	PCR conditions			Alleles (pb)			Repeat type	Location
			Primer [µM]	MgCl2 [mM]	°Tm	Expected size	Range size observed
SSR1	AGAGGACTCCATTTGTTTGCT	TGAGGGTGTTGGATGTTTTCT	0,2	2	50	206	170	210	AT	3′ UTR
SSR2	CATTGGGTTTCGCATCCAT	AGACAAGCCTAGGGGAAAGG	0,2	2	50	237	230	250	AG	3′ UTR
SSR9	TGCTCCGAGTTTTAGGGTTC	GCAGTTGGTAAAGTTGAGAGACG	0,2	2	50	193	220	240	AG	5′ UTR
SSR10	GCTTCCTATTGTGTTGCCTGA	ACTTTGGGTTTCGGGAATTG	0,2	2	50	185	170	190	AT	3′ UTR
SSR11	CAGCTGAAATAAGAGAGTGATTGG	CCCTCTTTTTCTCCTCCGAGT	0,2	2	50	180	180	210	AG	3′ UTR
SSR13	GCGGAATCCATTGTTTTTCA	CCGATGAGATATAGTCACGCAAA	0,2	2	50	190	160	210	AC	5′ UTR
SSR14	TGAAACCCATCTAGCTGAACG	TGGGTTGTTCCTTACAATCCAT	0,2	1,5	50	204	200	220	AT	3′ UTR
SSR15	GCTTGTTGATCAGCTTTCTTTG	TGGATCATAACCTTGCTAATGC	0,2	1,5	50	172	160	180	AT	3′ UTR
SSR18	CAGAGTGATTACCTTGGACGAA	TGTCCATTTTAGTCGCCAAT	0,2	1,5	50	179	180	230	AC	3′ UTR
SSR20	GCACATCACATAAAGTATCTTTCTCA	TTGCCTGGTGTCTTGCTATG	0,2	1,5	50	270	170	220	AT	3′ UTR
SSR36	ATGAACCACATGTCGGAGGA	GGGGATCCAAACGAAGTGTA	0,2	1,5	52	211	170	240	AG	3′ UTR
SSR37	CCAACTGAATCAACACACAGC	CCACACTGAAAAAGGGATCTG	0,3	2	50	212	260	330	AG	3′ UTR
SSR54	CGGCTGGTATGCTTACAAAGAT	GCACTTCCACTGTTTTTAACTTCC	0,2	1,5	50	197	190	210	AC	3′ UTR
SSR55	CACCTACATAGGCAGCCAAAA	ATTTGTGGGCGGAGGAAG	0,2	1,5	50	183	200	210	AG	5′ UTR
SSR57	AGTGAAAAGCAGCCCATTCT	GGCGAAGCTGAATTGAAAAA	0,2	1,5	50	183	200	210	AT	3′ UTR
SSR67	GCTTCTGTTCCATTATTCACCA	GCAGTGTGGGATCAATCAAT	0,2	1,5	50	207	180	240	AG	3′ UTR
SSR68	GAAGCAAACAACTACACCCAAA	AAGCCTCGGATTTCATAGCA	0,2	1,5	50	187	160	220	AG	3′ UTR
SSR72	GTGCTCGCAGTTTCTTCAAA	CCGCCGTTACTTCCTAATCA	0,2	1,5	50	158	130	170	AG	3′ UTR
SSR77	CATACCATAACTCCCCATCTCTC	TGCCGATTCTGATTTCTTCC	0,2	1,5	50	216	170	200	AT	5′ UTR
SSR92	TGGTTTGAGGATCAAGAAAGAA	GTGGTATCAACGCAGAGTGG	0,25	2,5	50	205	180	210	AAG	3′ UTR
SSR107	CATCCAACACCAGAAATACGC	TCCAACTTTATCATTTCTTCCAC	0,2	1,5	50	206	220	250	AAG	5′ UTR
SSR110	CACCCATATCCCAATCTTCTTC	GGGTAATTTTCACGGGGAAT	0,2	1,5	50	198	170	200	CTT	3′ UTR
SSR112	CTACGCCTACCACTTGCACA	CAGTGGAAGCCTCAAGATCC	0,2	1,5	50	203	200	220	TCT	3′ UTR
SSR118	AATCAAGGGTCAGAAGAAATGG	GCAAGAATGGATGTGGGTGT	0,2	1,5	50	180	130	180	AAG	5′ UTR
SSR121	AGCAACCTCCCAATCAGCTA	TGGTGAGTAAATGGGGGAAA	0,2	1,5	50	189	170	190	ATC	3′ UTR
SSR123	TCAGTGGAGCGCGTATATCT	GCGATCTCACCAAACCTCTC	0,2	1,5	50	216	190	210	ATC	5′ UTR
SSR126	TCCAAAAAGAAAACAAAAACACT	TTGAATGCATGTTTGATGGA	0,2	1,5	50	202	190	200	AGC	5′ UTR
SSR127	TTGGTTTGGCATAACTGCAA	GGTTTGCAACTCTCATGCTG	0,2	1,5	50	180	140	160	AAT	5′ UTR
SSR138	TCCGATCACTACTTCAGCACG	CAATTCGGGTTGTGAATCGGGT	0,2	1,5	50	138	130	160	AAT	3′ UTR
SSR146	AGGCTAATGAGGACGAAGCA	GGTTGCATTACAAAGCACTGA	0,2	1,5	50	187	160	210	AAAAG	3′ UTR