Table 3.
Conformations of the unpaired RNA nucleotide examined in the present paper and corresponding hydration of the bases
| Base | Nucleotide conformations containing more than 15 surrounding waters | Number of nucleotides |
Number of surrounding waters |
|---|---|---|---|
| Adenine | C3'-endo_anti_-g_t_g_g_t_-g | 56 | 273 |
| Adenine | C3'-endo_anti_t_t_t_g_t_-g | 7 | 77 |
| Adenine | C3'-endo_anti_t_t_g_g_t_-g | 7 | 27 |
| Adenine | C2'-exo_anti_-g_t_g_g_t_-g | 6 | 20 |
| Adenine | C3'-endo_anti_-g_t_t_g_t_-g | 2 | 20 |
| Guanine | C3'-endo_anti_-g_t_g_g_t_-g | 43 | 193 |
| Guanine | C2'-endo_anti_-g_t_g_t_-g_g | 12 | 29 |
| Guanine | C2'-endo_anti_-g_t_g_t_-g_t | 3 | 18 |
| Guanine | C3'-endo_anti_-g_t_g_g_-g_-g | 7 | 17 |
| Uracil | C3'-endo_anti_-g_t_g_g_t_-g | 10 | 55 |
| Uracil | C2'-endo_anti_g_t_g_t_-g_-g | 7 | 34 |
| Uracil | C3'-endo_anti_t_t_t_g_t_-g | 4 | 29 |
| Uracil | C2'-endo_anti_-g_t_g_t_-g_g | 4 | 18 |
| Uracil | C3'-endo_anti_t_t_g_g_t_-g | 4 | 17 |
| Cytosine | C3'-endo_anti_-g_t_g_g_t_-g | 20 | 114 |
| Cytosine | C2'-endo_anti_-g_t_g_t_-g_-g | 3 | 17 |
| Cytosine | C3'-endo_anti_t_t_t_g_t_g | 2 | 17 |
| Cytosine | C3'-endo_anti_-g_t_g_g_t_g | 4 | 16 |