Table 1. Allele frequency of ancestry markers in parental population and Informativeness (In).
AFR/EUR | AFR/AMR | AMR/EUR | ||||||||
rs # | Allele 1 | EUR | AFR | AMR | f | In | f | In | f | In |
rs1240709 | A | 0,766 | 0,050 | 0,103 | 0,530 | 0,304 | 0,010 | 0,005 | 0,447 | 0,246 |
rs2065160 | C | 0,088 | 0,487 | 0,875 | 0,195 | 0,105 | 0,173 | 0,091 | 0,620 | 0,355 |
rs2814778 | G | 0,006 | 0,983 | 0,019 | 0,953 | 0,630 | 0,930 | 0,604 | 0,003 | 0,002 |
rs3796384 | C | 0,154 | 0,783 | 0,875 | 0,398 | 0,215 | 0,015 | 0,007 | 0,520 | 0,290 |
rs2278354 | G | 0,120 | 0,703 | 0,839 | 0,351 | 0,190 | 0,026 | 0,013 | 0,518 | 0,288 |
rs267071 | C | 0,654 | 0,088 | 1,000 | 0,343 | 0,188 | 0,838 | 0,540 | 0,209 | 0,138 |
rs222541 | G | 0,257 | 0,971 | 0,018 | 0,538 | 0,316 | 0,908 | 0,582 | 0,120 | 0,070 |
rs1480642 | C | 0,994 | 0,121 | 0,621 | 0,772 | 0,483 | 0,268 | 0,143 | 0,223 | 0,139 |
rs4305737 | A | 0,250 | 0,921 | 1,000 | 0,464 | 0,259 | 0,041 | 0,028 | 0,600 | 0,380 |
rs285 | T | 0,578 | 0,954 | 0,448 | 0,197 | 0,111 | 0,305 | 0,173 | 0,017 | 0,008 |
rs3176921 | T | 0,929 | 0,238 | 0,983 | 0,493 | 0,278 | 0,584 | 0,351 | 0,017 | 0,009 |
rs803733 | C | 0,880 | 0,013 | 0,411 | 0,761 | 0,470 | 0,237 | 0,144 | 0,241 | 0,128 |
rs7349 | T | 0,062 | 0,969 | 0,000 | 0,824 | 0,507 | 0,939 | 0,623 | 0,032 | 0,022 |
rs730570 | A | 0,896 | 0,197 | 0,054 | 0,492 | 0,274 | 0,047 | 0,025 | 0,712 | 0,421 |
rs1129038 | C | 0,224 | 0,996 | 0,983 | 0,625 | 0,389 | 0,004 | 0,002 | 0,601 | 0,362 |
rs1426654 | G | 0,013 | 0,967 | 0,931 | 0,910 | 0,586 | 0,007 | 0,003 | 0,846 | 0,532 |
rs734780 | C | 0,062 | 0,710 | 0,854 | 0,444 | 0,250 | 0,030 | 0,015 | 0,633 | 0,366 |
rs730086 | C | 0,667 | 0,063 | 1,000 | 0,393 | 0,220 | 0,881 | 0,574 | 0,200 | 0,132 |
rs6034866 | A | 0,083 | 0,954 | 0,143 | 0,759 | 0,456 | 0,664 | 0,390 | 0,009 | 0,004 |
rs310612 | A | 0,763 | 0,013 | 0,966 | 0,593 | 0,360 | 0,909 | 0,584 | 0,088 | 0,048 |
rs727563 | C | 0,253 | 0,811 | 0,948 | 0,312 | 0,166 | 0,045 | 0,024 | 0,504 | 0,288 |
rs # = reference sequence number; EUR = European; AFR = African; AMR = Amerindian; f = f−value; In = Informativeness statistic.