Skip to main content
. 2011 Jul 22;3:26. doi: 10.1186/1758-2946-3-26

Table 4.

Summary statistics per-AID for color-Tanimoto (CT) optimized 3-D similarity.

XT=ST CT-opt XT=CT CT-opt XT=ComboT CT-opt

Y=NN Y=NI Y=NN-NI Y=NN Y=NI Y=NN-NI Y=NN Y=NI Y=NN-NI
μ[μ(XT Y )]
Screening 0.44 0.43 0.01 0.20 0.19 0.01 0.64 0.62 0.02
Confirmatory 0.46 0.44 0.02 0.21 0.20 0.02 0.67 0.64 0.04
Summary 0.57 0.54 0.03 0.43 0.37 0.07 1.00 0.90 0.10
Other 0.46 0.43 0.03 0.23 0.20 0.03 0.68 0.62 0.06
Unspecified 0.44 0.44 0.00 0.17 0.16 0.00 0.61 0.60 0.00
All 0.45 0.44 0.02 0.21 0.19 0.01 0.66 0.63 0.03
σ[μ(XT Y )]
Screening 0.05 0.03 0.03 0.04 0.04 0.02 0.08 0.07 0.05
Confirmatory 0.07 0.05 0.04 0.08 0.05 0.05 0.14 0.09 0.08
Summary 0.18 0.14 0.07 0.26 0.19 0.10 0.43 0.33 0.15
Other 0.07 0.07 0.04 0.07 0.06 0.04 0.13 0.12 0.08
Unspecified 0.03 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.05 0.03 0.04
All 0.06 0.05 0.04 0.07 0.05 0.04 0.13 0.09 0.07
μ[σ(XT Y )]
Screening 0.12 0.12 0.00 0.08 0.06 0.00 0.17 0.15 0.01
Confirmatory 0.13 0.13 0.01 0.10 0.08 0.01 0.21 0.18 0.01
Summary 0.16 0.15 0.03 0.17 0.16 0.04 0.32 0.29 0.07
Other 0.13 0.12 0.01 0.11 0.08 0.01 0.22 0.17 0.01
Unspecified 0.15 0.14 0.01 0.10 0.09 0.00 0.21 0.20 0.01
All 0.13 0.13 0.01 0.09 0.08 0.01 0.20 0.17 0.01
σ[σ(XT Y )]
Screening 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.05 0.04 0.02
Confirmatory 0.03 0.02 0.01 0.05 0.04 0.02 0.07 0.06 0.03
Summary 0.08 0.05 0.05 0.11 0.08 0.05 0.19 0.12 0.10
Other 0.03 0.03 0.01 0.06 0.04 0.01 0.08 0.07 0.02
Unspecified 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.00 0.04 0.02 0.01
All 0.03 0.02 0.01 0.05 0.04 0.01 0.07 0.05 0.03

The overall average (μ) and standard deviation (σ) of the AID-specific average and standard deviation for noninactive-noninactive (NN) pairs and noninactive-inactive (NI) pairs of 1,389 AIDs in the PubChem BioAssay database.