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. 2011 Dec;193(23):6505–6511. doi: 10.1128/JB.05681-11

Table 2.

Primers and oligonucleotides used in this study

Primer name Sequence
OmpT2 5′ GCTTCTTGGGATCCAATCCACTGCC 3′
OmpT3 5′ GCAGTGGATTGGATCCCAAGAAGCG 3′
OmpT7 5′ TAGGGAGATGGTGCGCTTCGTC 3′
OmpT8 5′ ACCCTTGTGCTTGCGGTAGTGG 3′
ToxR1 5′ TATGACTCCACACGAGTG 3′
ToxR2 5′ GGCTACGCCCCGGGGCTTAGGGGATCAAAG 3′
ToxR3 5′ CCCTAAGCCCCGGGGCGTAGCCGTCAATATGCC 3′
ToxR4 5′ GGCGATCAACATGCCCAAG 3′
ToxRV1 5′ TGTAAAGTAAGCTGGTGTAG 3′
ToxRV2 5′ CTTAACTTTGCGTAGAAGAG 3′
ToxRV3 5′ CCGCATCATCCATAATAAAGAC 3′
ToxRV4 5′ CAGTTGCCTCCTTCAATAAATC 3′
fur.745 5′ GTTGGCGTTTTTATTCCACCAG 3′
fur.nhe.xho.rev 5′ GGCTCGAGTATTTAGCTAGCTTTCTTCGGCTTGTGAGCGTTAG 3′
Flu1 5′ CTAGCTACCCATACGACGTCCCAGACTACGCTTAAC 3′
Flu2 5′ TCGAGTTAAGCGTAGTCTGGGACGTCGTATGGGTAG 3′
fur.1254.BseRI 5′ AGAACAGAGGAGGGAAAGTATATGTCAGACAA 3′
furV-R 5′ GGAAACAGCTATGACCATG 3′
Nor-16S-F 5′ AGGTGTGGCTTTCGGAGCTAAC 3′
Nor-16S-R 5′ CCACCATTACGTGCTGGCAAAC 3′
Nor-ompT-F2 5′ GGTGATGCACTGATTG 3′
Nor-ompT-R2 5′ AACCCAGAGTTGTACC 3′
Nor-ToxR-BF 5′ TGGCCCAACGTCCAAACGAG 3′
Nor-ToxR-BR 5′ TGGCTGATGAAGGCACACTG 3′
EMSA oligonucleotides
    SOD.for.flu 5′ 6-FAM-TTGTTAATGATATTAATTATCATTAACAT 3′
    SOD.rev 5′ ATGTTAATGATAATTAATATCATTAACAA 3′
    OMPT.for.flu 5′ 6-FAM-CATGAAATAAATGTAATTTATTGAATTTTAAGG 3′
    OMPT.rev 5′ CCTTAAAATTCAATAAATTACATTTATTTCATG 3′
    CONTROL.for.flu 5′ 6-FAM-CGAGTTTTAAGTTATTTACTGTAAGTAAAGTA 3′
    CONTROL.rev 5′ GTACTTTACTTACAGTAAATAACTTAAAACTCG 3′